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linux下python多版本环境设置(数据科学研究依赖环境安装

linux下python多版本环境设置(数据科学研究依赖环境安装

作者: 八幡大老师 | 来源:发表于2018-08-21 08:55 被阅读0次

    linux下python多版本环境设置(数据科学研究依赖环境安装)
    经常遇到这样的情况:
    系统自带的Python是2.6,自己需要Python 2.7中的某些特性;
    系统自带的Python是2.x,自己需要Python 3.x;
    此时需要在系统中安装多个Python,但又不能影响系统自带的Python,即需要实现Python的多版本共存。
    pyenv就是这样一个Python版本管理器,除此之外,还可以使用virtualenv创建独立的纯净虚拟环境

    一、pyenv安装

    使用vm虚拟机安装centos7系统
    1)默认安装方式使用NAT网络连接方式 确认IP后可以直接实现宿主机和虚拟机的互联,也能直接连接互联网
    2)在centos安装配置界面中的软件选择界面,需要选择带有GHOME界面的配置,否则安装后的系统是不带界面的,使用不便

    1.相关依赖软件安装

    1)安装GCC
    yum install gcc
    2)安装git,需要用git获取pyenv的代码
    yum -y install git
    3)其他工具依赖
    yum install -y readline readline-devel readline-static openssl openssl-devel openssl-static sqlite-devel bzip2-devel bzip2-libs

    2.pyenv获取及配置

    1)获取pyenv,安装位置选择在root根目录下,使用.隐藏目录,并设置环境变量。这里设置为root用户可用了,其实可以基于其他用户clone一份自己用的独立环境
    git clone https://github.com/yyuu/pyenv.git ~/.pyenv
    2)设置相关环境变量,使pyenv生效

    echo 'export PYENV_ROOT="/root/.pyenv"' >>  ~/.bash_profile
    echo 'export PATH="$PYENV_ROOT/bin:$PATH"' >> ~/.bash_profile
    echo 'eval "$(pyenv init -)"' >> ~/.bash_profile
    source ~/.bash_profile
    

    二、pyenv的使用

    1.安装不同版本的python

    pyenv install --list #查看可安装的python版本
    pyenv install 3.6.5  #安装python3.6.5
    pyenv uninstall 3.6.5 #卸载python3.6.5
    

    补充:网络问题导致安装缓慢或无法进行

    如anaconda之类大容量的版本,由于网络的问题,总是连接中断,安装失败。此时可以先从官方网站下载安装包,然后放在~/.pyenv/cache文件中(注意cache是个文件),然后执行pyenv install 此版本,pyenv会自动先从此文件夹中搜索

    wget https://www.python.org/ftp/python/2.7.15/Python-2.7.15.tar.xz
    cp Python-2.7.15.tar.xz  ~/.pyenv/cache
    pyenv install 2.7.15
    

    2.更新pyenv

    安装完之后,需要更新一下才能看到已经安装的版本

    pyenv rehash
    pyenv versions #查看已经安装好的版本,带*号的为当前使用的版本
    

    3.选择版本

    pyenv global 3.6.5 #设置全局版本,即系统使用的将是此版本
    这样在任意目录下执行python命令进入的都是3.6.5环境
    pyenv local 2.7.15 #当前目录下的使用版本,有点类似virtualenv
    在当前目录下执行 python 进入的都是2.7.15环境
    pyenv global system #重新设置全局版本为系统的版本
    而除了root用户(设置pyenv的用户)外,其他用户使用的仍是系统默认的2.7.5版本的python

    三、virtualenv安装及使用

    1.python virtualenv安装

    可以直接使用pip安装virtualenv也行,但是通过pyenv插件的形式安装virtualenv的虚拟环境更加方便。

    git clone https://github.com/pyenv/pyenv-virtualenv.git
    cd pyenv-virtualenv/
    ./install.sh
    

    安装virtualenv插件,安装在主文件夹下的.pyenv文件夹中。

    git clone https://github.com/yyuu/pyenv-virtualenv.git ~/.pyenv/plugins/pyenv-virtualenv
    echo 'eval "$(pyenv virtualenv-init -)"' >> ~/.bash_profile
    ./install.sh
    

    2.创建虚拟环境

    创建一个2.7.15的虚拟环境

    pyenv virtualenv 2.7.15 py27
    source ~/.bash_profile #执行这一步使当前用户环境都使用这个virtualenv环境
    

    这条命令在本机上创建了一个名为env271的python虚拟环境,这个环境的真实目录位于:~/.pyenv/versions/
    注意,命令中的 ‘2.7.15’ 必须是一个安装前面步骤已经安装好的python版本, 否则会出错。
    可以通过pyenv versions 命令来查看当前的虚拟环境,列表中有一个 py27。

    3.切换和使用新的python虚拟环境:

    执行以下命令
    pyenv activate py27
    就能切换为py27这个版本的虚拟环境。
    通过输入python --version查看现在版本,可以发现处于虚拟环境下了。
    如果要切换回系统环境, 运行这个命令即可
    pyenv deactivate
    删除这个虚拟环境,只要直接删除它所在的目录就好:
    rm -rf ~/.pyenv/versions/py27/
    或者使用卸载命令:
    pyenv uninstall py27

    四、jupyter notebook 安装

    1.安装数据科学依赖的软件

    yum install bzip2 -y
    yum groupinstall "Development Tools" -y
    

    2.使用pyenv进入python3.6.5环境

    在python3环境下实现数据科学的框架搭建

    pyenv local 3.6.5
    python --version
    pip install ipython jupyter notebook
    

    3.jupyter配置

    jupyter安装完成后,验证命令是否可用并生成一个jupyter的配置文件。(确保pyenv环境正确)
    jupyter notebook --generate-config

    4.安全设置

    为了比较安全的访问服务器资源,可以设置登录密码和设置https来实现安全登录。有条件可以通过安全认证中心来发放秘钥和认证。
    首先打开ipython,生成sha1的密码,如下:

    from notebook.auth import passwd
    passwd()
    #Enter password   sunline
    #output sha1:5862585fb33e:afeb36aa85d02e0c37b0de7d7e6a4bc766e9fa6c
    

    然后生成一个自签名认证的key,如下:
    openssl req -x509 -nodes -days 365 -newkey rsa:4096 -keyout jkey.key -out jcert.pem
    最后修改增加配置文件中的内容:

    vim /home/user/.jupyter/jupyter_notebook_config.py
    c.NotebookApp.password = 'sha1:<your-sha1-hash-value>'
    c.NotebookApp.port = 8888
    c.NotebookApp.ip = '192.168.245.128'
    c.NotebookApp.open_browser = False
    c.NotebookApp.certfile = '/home/user/jcert.pem'
    c.NotebookApp.keyfile = '/home/user/jkey.key'
    

    5.jupyter notebook使用

    由于jupyter使用的8888作为默认端口,需要把端口给开放并重启防火墙。执行如下命令
    firewall-cmd --zone=public --add-port=8888/tcp --permanent
    然后重启防火墙
    systemctl restart firewalld.service
    到这里所有的安装和基本的设置都已经完成,直接在命令行输入:jupyter notebook.就可以启动进程。

    6.实现后台运行并输出日志

    创建start.sh 脚本内容为

    nohup  start.sh  >> output.log 2>&1 &
    nohup  /root/jupyterNotebook/start.sh  >> /root/jupyterNotebook/output.log 2>&1 &
    

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