Shiny做网站

作者: 落寞的橙子 | 来源:发表于2022-02-03 00:58 被阅读0次

    把自己的数据做成网页版,既提升文章的可读性又方便交流
    下面这几个例子都挺好,尤其第一个
    R : Shiny|搭建单细胞数据分析云平台
    一个在线火山图的Shiny应用
    (转帖)Shiny和Plotly实现可交互DNA甲基化分析包ChAMP
    Shiny介绍
    我的一个简单例子
    设置说明
    关键是花点时间理解下数据结构,这些可以参照上述教程,不再赘述。
    几个提醒
    1、新建data把数据文件放在app根目录的data文件夹
    2、参照官网的说明并注册账号和设置,以及上传数据
    3、数据不要太大

    上传数据
    1、注册并登陆,获取密钥

    library(rsconnect)
    rsconnect::setAccountInfo(name='注册的名字',token='注册后会得到', secret='注册后会得到')
    

    2、上传

    rsconnect::deployApp("app路径")#包含了data文件夹
    

    对于bioconductor的包,在上传前要在你的R中运行

    options(repos = BiocManager::repositories())
    

    如果报错内存不足

    > setwd("~/nanopore_human_annotation/")
    > rsconnect::configureApp("nanopore_human_annotation", size="xxlarge")
    

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