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作者: 鬼孑孓 | 来源:发表于2020-05-04 21:52 被阅读0次

    1.利用R包TCGAbiolinks进行各种数据下载

    2.RNA-seq的counts,RPM, RPKM, FPK值到底有什么区别?

    RPKM与FPKM的区别:RPKM值适用于单末端RNA-seq实验数据,FPKM适用于双末端RNA-seq测序数据。

    RPKM/FPKM适用于基因长度波动较大的测序方法,如lncRNA-seq测序,lncRNA的长度在200-100000碱基不等。


    3.通过整理TCGA数据,探索某癌症的癌组织和正常组织的差异基因。

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