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OmicStudio-【组学绘图通用】云工具资料汇总(精选)-2

OmicStudio-【组学绘图通用】云工具资料汇总(精选)-2

作者: OmicStudio | 来源:发表于2020-08-19 21:08 被阅读0次

    联川生物云平台自上线以来,为科研分析和作图提供了不少助力,旨在使您能够轻松快速地完成一个科研分析,并得到精美的可视化呈现。在此,我们搜集整理了相关资料,为您精心挑选了重要的说明文档,帮助您更快上手。

    本文档包含了联川生物发布过的所有形式的云平台相关资料,包括:

    使用指南:由该工具的生信开发人员撰写,系统性较强,且地址永久有效,即使发布了最新的使用指南,也可以用这个地址访问,推荐指数 *****

    B站:为直播录制视频,内容同时兼顾原理和操作,最后还有答疑环节,推荐指数 *****

    微信稿:比使用指南更简明,侧重云工具的某些特点,推荐指数 ****

    FAQ和SOP:一般放在云平台的资料中心,是平时售后中沉淀下来的问题,回答和解决特定的问题,推荐指数 ***

    另外,微信稿中的有些链接已经过期,但是它们都可以通过登陆云平台找到:https://www.omicstudio.cn/ ,如果打不开,从这个网页里找就可以了。

    若需要在文章中引用本平台,可以参考如下文本:Bioinformatic analysis was performed using the OmicStudio tools at https://www.omicstudio.cn/tool.


    热图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/4

    使用指南:联川生物云平台-使用指南-热图-V2.11-2019.1.24-lfy https://www.omicstudio.cn/doc/414

    B站:热图在各组学中的应用| 联川生物云平台https://www.bilibili.com/video/BV1XE411W7Hw (地址一)https://www.omicstudio.cn/doc/683 (地址二)

    微信稿:不同样本的差异通路如何绘制热图?| 生信快闪 https://mp.weixin.qq.com/s/_r-xmBNIz4PLYN5utlA7Yg

    微信稿:绘制3000行热图,基因名如何看得清? | 生信快闪  https://mp.weixin.qq.com/s/SJI8yvdNxyNeWBpKDR2KQQhttps://www.omicstudio.cn/doc/646(pdf版)

    FAQ:常见图形怎么看——热图https://www.omicstudio.cn/doc/211

    FAQ:热图绘制时FPKM值是如何进行转换的?https://www.omicstudio.cn/doc/98

    SOP:聚类热图如何调整样本顺序https://www.omicstudio.cn/doc/712


    韦恩图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/6

    使用指南:联川生物云平台-使用指南-韦恩图-V2.5-2019.5.30-lfyhttps://www.omicstudio.cn/doc/478

    微信稿:小姐姐告诉你如何画韦恩图| 生信快闪 https://mp.weixin.qq.com/s/IW719SaPq6cvLtefUVqTxg

    B站:韦恩图的应用与实操演示 | 联川生物云平台https://www.bilibili.com/video/BV1NQ4y1T7yZ


    高级韦恩图:UpSet图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/43

    使用指南:云平台UpSet工具说明 https://www.omicstudio.cn/doc/694

    微信稿:韦恩图只能画5组?不存在的 https://mp.weixin.qq.com/s/X9UrWBIo49rTcBc_bOWG-g

    B站:UpSet图原理讲解+实操演示 | 联川生物云平台https://www.bilibili.com/video/BV11e411W77C


    箱线图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/1

    SOP:联川生物云平台箱线图绘制SOP https://www.omicstudio.cn/doc/827


    小提琴图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/45

    微信稿:听说这里可以免费画小提琴图??? https://mp.weixin.qq.com/s/rNOGuZYheviwUNnYe7UgBg

    B站:小提琴图绘制讲解 | 联川生物云平台 https://www.bilibili.com/video/BV1kA411b7qt

    FAQ:常见图形怎么看——小提琴图 https://www.omicstudio.cn/doc/213


    点线图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/44

    使用指南:点线图简要操作手册及演示视频 https://www.omicstudio.cn/doc/693

    微信稿:点线图---一样的图,不一样的花样 https://mp.weixin.qq.com/s/tc9qYgl2AuLJXcEUoFDTqg

    B站:点线图的应用和实操演练 | 联川生物云平台 https://www.bilibili.com/video/BV1f5411t7Bh


    火山图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/7

    使用指南:绘制火山图:1-简介https://www.omicstudio.cn/doc/463

    使用指南:绘制火山图:2-快速绘制-示例数据https://www.omicstudio.cn/doc/465

    使用指南:绘制火山图:2-快速绘制-使用自己的数据https://www.omicstudio.cn/doc/464

    使用指南:绘制火山图:3-数据处理+图片解读+绘制Inf值+数据下载https://www.omicstudio.cn/doc/466

    使用指南:绘制火山图:4-其他常见参数+图片优化+个性化调整https://www.omicstudio.cn/doc/467

    使用指南:绘制火山图:5-图片下载https://www.omicstudio.cn/doc/468

    微信稿:云平台火山图使用指南| 云课堂(27) https://mp.weixin.qq.com/s/61P3kCDgT0SRSM7NfLwzDA

    FAQ:常见图形怎么看——散点图https://www.omicstudio.cn/doc/208


    二维PCA图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/13

    B站:联川生物云平台 | PCA知识详解+实操演练 https://www.bilibili.com/video/BV1me411s7X9

    微信稿:小姐姐告诉你2秒钟的PCA图2分钟就能学会 https://mp.weixin.qq.com/s/wblFWrhu2Tq49qJ8PYNLPA


    三维PCA图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/14

    使用指南:联川生物云平台-使用指南-三维PCA图-V1.4-2019.5.29-lfyhttps://www.omicstudio.cn/doc/477

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:1-介绍https://www.omicstudio.cn/doc/432

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:2-下载示例数据https://www.omicstudio.cn/doc/433

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:3-只上传输入文件https://www.omicstudio.cn/doc/434

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:4-下载https://www.omicstudio.cn/doc/435

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:5-上传分组文件https://www.omicstudio.cn/doc/436

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:6-输入文件格式https://www.omicstudio.cn/doc/437

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:7-分组文件格式https://www.omicstudio.cn/doc/438

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:8-调整颜色https://www.omicstudio.cn/doc/439

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:9-数据处理和下载https://www.omicstudio.cn/doc/440

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:10.主要参数调整https://www.omicstudio.cn/doc/441

    使用指南(视频):绘制三维PCA图:11-总结https://www.omicstudio.cn/doc/442

    微信稿:三分钟绘制一张优美的三维PCA图 | 云平台https://mp.weixin.qq.com/s/OA8McuCIotriTQd57kaShQ


    Circos

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/50

    使用指南:Circos云工具绘图使用手册 https://www.omicstudio.cn/doc/832

    B站:OmicStudio开挂绘图 | 在线绘制各种类型的Circos图 https://www.bilibili.com/video/BV15z4y1Q79f

    微信稿https://mp.weixin.qq.com/s/FunERSVx_bBsQt8qbxjtcA

    视频教程:已内嵌在云工具中


    网络图

    网址:https://www.omicstudio.cn/tool/56

    使用指南:网络图云工具使用 https://www.omicstudio.cn/doc/837

    B站:OmicStudio开挂绘图 | 网络图云工具在线绘制以及朱缨花图实操https://www.bilibili.com/video/BV1w64y1c7Gg

    微信稿:一分钟就能完成多组学网络关系图,了解下https://mp.weixin.qq.com/s/tjxMzAw9QlXkkKb7dM3q8A


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