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05-生存分析

05-生存分析

作者: 译文达练 | 来源:发表于2021-08-25 21:16 被阅读0次
    library(survival)
    Lung <- lung
    

    Kaplan-Meier曲线

    #基本流程:Surv()提取生存时间;survfit()生存模型;survdiff():多组时分析差异
    #绘图:plot
    
    Lusurv <- Surv(time=Lung$time,event=Lung$status)
    #输出结局时间(+:还没有死亡)
    
    Lufit <- survfit(Lusurv~Lung$sex)
    #观察sex对生存时间的关系
    

    绘图及美化

    plot(Lufit,cof.int="none",col=c("red","blue"),lwd=2,mark.time=T) 
    #cof.int 是否显示置信区间
    #mark.time=T 显示末端时间点
    abline(h=0.5) 
    #添加中位线
    abline(v=270,lty=3)
    legend("bottomleft",c("Male","Female"),col=c("red","blue"),lwd=2)
    text(900,0.9,"p=0.001")
    
    survdiff(Lusurv~Lung$sex)
    #两组之间是否有统计学差异
    
    

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