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Giraph 源码分析(五)—— 加载数据+同步总结

Giraph 源码分析(五)—— 加载数据+同步总结

作者: 数澜科技 | 来源:发表于2019-08-12 15:02 被阅读0次

    作者|白松

    关于Giraph 共有九个章节,本文第五个章节。

    环境:在单机上(机器名:giraphx)启动了2个workers。

    输入:SSSP文件夹,里面有1.txt和2.txt两个文件。

    1、在Worker向Master汇报健康状况后,就开始等待Master创建InputSplit。

    方法:每个Worker通过检某个Znode节点是否存在,同时在此Znode上设置Watcher。若不存在,就通过BSPEvent的waitForever()方法释放当前线程的锁,陷入等待状态。一直等到master创建该znode。此步骤位于BSPServiceWorker类中的startSuperStep方法中,等待代码如下:

    image
    2、Master调用createInputSplits()方法创建InputSplit。 image

    在generateInputSplits()方法中,根据用户设定的VertexInputFormat获得InputSplits。代码如下:

    image

    其中minSplitCountHint为创建split的最小数目,其值如下:

    minSplitCountHint = Workers数目 * NUM_INPUT_THREADS

    NUM_INPUT_THREADS表示 每个Input split loading的线程数目,默认值为1 。 经查证,在TextVertexValueInputFormat抽象类中的getSplits()方法中的minSplitCountHint参数被忽略。用户输入的VertexInputFormat继承TextVertexValueInputFormat抽象类。

    如果得到的splits.size小于minSplitCountHint,那么有些worker就没被用上。

    得到split信息后,要把这些信息写到Zookeeper上,以便其他workers访问。上面得到的split信息如下:

    [hdfs://giraphx:9000/user/root/SSSP/1.txt:0+66, hdfs://giraphx:9000/user/root/SSSP/2.txt:0+46]

    遍历splits List,为每个split创建一个Znode,值为split的信息。如为split-0创建Znode,值为:hdfs://giraphx:9000/user/root/SSSP/1.txt:0+66

    /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDir/0

    为split-1创建znode(如下),值为:hdfs://giraphx:9000/user/root/SSSP/2.txt:0+46

    /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDir/1

    最后创建znode: /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitsAllReady 表示所有splits都创建好了。

    3、Master根据splits创建Partitions。首先确定partition的数目。

    image

    BSPServiceMaster中的MasterGraphPartitioner<I.V,E,M>对象默认为HashMasterPartitioner。它的createInitialPartitionOwners()方法如下:

    image

    上面代码中是在工具类PartitionUtils计算Partition的数目,计算公式如下:

    partitionCount=PARTITION_COUNT_MULTIPLIER * availableWorkerInfos.size() * availableWorkerInfos.size() ,其中PARTITION_COUNT_MULTIPLIER表示Multiplier for the current workers squared,默认值为1 。

    可见,partitionCount值为4(122)。创建的partitionOwnerList信息如下:

    [(id=0,cur=Worker(hostname=giraphx, MRtaskID=1, port=30001),prev=null,ckpt_file=null),

    (id=1,cur=Worker(hostname=giraphx, MRtaskID=2, port=30002),prev=null,ckpt_file=null),

    (id=2,cur=Worker(hostname=giraphx, MRtaskID=1, port=30001),prev=null,ckpt_file=null),

    (id=3,cur=Worker(hostname=giraphx, MRtaskID=2, port=30002),prev=null,ckpt_file=null)]

    4、Master创建Znode:/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_partitionExchangeDir,用于后面的exchange partition。

    5、Master最后在assignPartitionOwners()方法中

    把masterinfo,chosenWorkerInfoList,partitionOwners等信息写入Znode中(作为Znode的data),该Znode的路径为: /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_addressesAndPartitions 。

    Master调用barrierOnWorkerList()方法开始等待各个Worker完成数据加载。调用关系如下:

    image

    barrierOnWorkerList中创建znode,path=/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDoneDir 。然后检查该znode的子节点数目是否等于workers的数目,若不等于,则线程陷入等待状态。后面某个worker完成数据加载后,会创建子node(如 /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDoneDir/giraphx_1)来激活该线程继续判断。

    6、当Master创建第5步的znode后,会激活worker。

    每个worker从znode上读出data,data包含masterInfo,WorkerInfoList和partitionOwnerList,然后各个worker开始加载数据。

    把partitionOwnerList复制给BSPServiceWorker类中的workerGraphPartitioner(默认为HashWorkerPartitioner类型)对象的partitionOwnerList变量,后续每个顶点把根据vertexID通过workerGraphPartitioner对象获取其对应的partitionOwner。

    image

    每个Worker从znode: /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDir获取子节点,得到inputSplitPathList,内容如下:

    [/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDir/1,

    /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDir/0]

    然后每个Worker创建N个InputsCallable线程读取数据。N=Min(NUM_INPUT_THREADS,maxInputSplitThread),其中NUM_INPUT_THREADS默认值为1,maxInputSplitThread=(InputSplitSize-1/maxWorkers +1

    那么,默认每个worker就是创建一个线程来加载数据。

    在InputSplitsHandler类中的reserveInputSplit()方法中,每个worker都是遍历inputSplitPathList,通过创建znode来保留(标识要处理)的split。代码及注释如下:

    image

    当用reserveInputSplit()方法获取某个znode后,loadSplitsCallable类的loadInputSplit方法就开始通过该znode获取其HDFS的路径信息,然后读入数据、重分布数据。

    image image

    VertexInputSplitsCallable类的readInputSplit()方法如下:

    image

    7、每个worker加载完数据后,调用waitForOtherWorkers()方法等待其他workers都处理完split。

    image

    策略如下,每个worker在/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDoneDir目录下创建子节点,后面追加自己的worker信息,如worker1、worker2创建的子节点分别如下:

    /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDoneDir/giraphx_1

    /_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDoneDir/giraphx_2

    创建完后,然后等待master创建/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitsAllDone。

    8、从第5步骤可知,若master发现/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitDoneDir下的子节点数目等于workers的总数目,就会在coordinateInputSplits()方法中创建

    _hadoopBsp/job_201404102333_0013/_vertexInputSplitsAllDone,告诉每个worker,所有的worker都处理完了split。

    9、最后就是就行全局同步。

    master创建znode,path=/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_workerFinishedDir ,然后再调用barrierOnWorkerList方法检查该znode的子节点数目是否等于workers的数目,若不等于,则线程陷入等待状态。等待worker创建子节点来激活该线程继续判断。

    每个worker获取自身的Partition Stats,进入finishSuperStep方法中,等待所有的Request都被处理完;把自身的Aggregator信息发送给master;创建子节点,如/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_workerFinishedDir/giraphx_1,data为该worker的partitionStatsList和workerSentMessages统计量;

    最后调用waitForOtherWorkers()方法等待master创建/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_superstepFinished 节点。

    master发现/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_workerFinishedDir的子节点数目等于workers数目后,根据/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_workerFinishedDir子节点上的data收集每个worker发送的aggregator信息,汇总为globalStats。

    Master若发现全局信息中(1)所有顶点都voteHalt且没有消息传递,或(2)达到最大迭代次数 时,设置 globalStats.setHaltComputation(true)。告诉works结束迭代。

    master创建/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_superstepFinished 节点,data为globalStats。告诉所有workers当前超级步结束。

    每个Worker检测到master创建/_hadoopBsp/job_201404102333_0013/_applicationAttemptsDir/0/_superstepDir/-1/_superstepFinished 节点后,读出该znode的数据,即全局的统计信息。然后决定是否继续下一次迭代。

    10、同步之后开始下一个超级步。

    11、master和workers同步过程总结。

    (1)master创建znode A,然后检测A的子节点数目是否等于workers数目,不等于就陷入等待。某个worker创建一个子节点后,就会唤醒master进行检测一次。

    (2)每个worker进行自己的工作,完成后,创建A的子节点A1。然后等待master创建znode B。

    (3)若master检测到A的子节点数目等于workers的数目时,创建Znode B

    (4)master创建B 节点后,会激活各个worker。同步结束,各个worker就可以开始下一个超步。

    本质是通过znode B来进行全局同步的。

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