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生信星球学习小组第11期Day--3 王建新

生信星球学习小组第11期Day--3 王建新

作者: ad6d3fe3600f | 来源:发表于2018-12-19 23:25 被阅读5次

    今天是第3天,主要是Linux环境下的软件安装


    Linux环境下的软件安装.png

    如何下载miniconda

    搜索“miniconda” 找到linux系统适合自己服务器位数的安装python3.6对应的版本下载链接
    wget 下载链接

    如何安装miniconda

    bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    注:最后还得激活:source ~/.bashrc 来激活conda

    添加国内镜像

    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --set show_channel_urls yes

    开始使用conda

    查看当前所有软件列表 conda list
    搜索软件 conda search fastqc
    安装软件 conda install fastqc -y
    卸载软件conda remove fastqc -y

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