(1)对应一些R包的图片,R原生绘图的方法
#create images device
pdf(paste(args[3],".karyoplote.pdf",sep=""),width=12,height=10) #先存一个pdf 要保存的文件名
pdf_dev<-dev.cur() #save a pdf device obj in variable #保存设备到一个变量里
png(paste(args[3],".karyoplote.png",sep=""),res =300,units = "in",width=12,height=10)
dev.control("enable") #设备dev控制开关打开
kp <- plotKaryotype(genome = genome_version,chromosomes=paste0("chr", c(1:22,"X")))
#画图对象存到变量里
kp 执行对象内容
dev.copy(which=pdf_dev) #拷贝之前备份的 对象到现在的设备中
dev.off()
dev.off()
(2)ggplot对象
ggsave()
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