“序列分析基础”是什么

小伙伴的某个考试有少部分生物信息学内容，她没涉及过这些内容。但有个大概复习大纲，其中有一些题目。因为时间紧迫，我就直接给她讲了讲。但是有一个题，题目是《序列分析基础》。
一看这个题目很简单，但我却突然解释不来。

大脑里迅速闪过：比对，blast，进化，相似，基于局部基于全局，一级结构决定高级结构。。。。但都不像答案。

突然发现，我以前竟然就写过序列比对的概念中就有解释：

相似性similarity和同源性homology是序列比较和分析的基础。
关于两者区别和联系请参照我之前的博文。
简单来说，
相似性指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨基酸残基顺序占的比例高低。
同源性是序列同源或不同源的一种论断，是个定性的概念，没有度的差异，而相似性是量化的。
也就是说两条序列要么同源要么不同源，不可能具有多或少的数量关系。

推荐想详细看到看我的这个专题核酸和蛋白质序列比对与序列特征分析,含26篇文章，包含核酸和蛋白质。