gsea分析这方面教程我在《生信技能树》公众号写了不少了,不管是芯片还是测序的表达矩阵,都是一样的,把基因排序即可...
得到表达矩阵后最经典的分析就是GSEA:看看基因全局表达量的变化是否有某些特定的基因集合的倾向性。 GSEA分析合...
背景 GSEA、GSVA、ssGSEA和GO、KEGG富集分析之间的区别? 从输入的表达矩阵入手1. GSEA的输...
单细胞富集分析系列: 单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com...
单细胞GSEA分析需要的文件有两个:1. 单细胞基因表达变化数据(两列,一列是geneid/gene symbol...
问题 一、有的文章只提供TPM的单细胞表达矩阵,可以用seurat分析吗? 二、分析流程和用count矩阵有什么不...
对样本进行分级后,通路的分析不适合传统的kegg和gsea分析,下面把单细胞的gsva分析带入tcga分析,原理一...
单细胞数据读入:10X数据,表达矩阵数据 细胞表达谱过滤 表达矩阵标准化 计算高显著变化的基因 PCA降维分析:碎...
本文标题:对单细胞表达矩阵做gsea分析
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