IMvigor210是个神奇的数据集，之前在R>>IMvigor210CoreBiologies免疫反应这篇文章中介绍过。下面就来看看大佬们都是怎么应用的。
Title: Infiltration and Polarization of Tumor-associated Macrophages Predict Prognosis and Therapeutic Benefit in Muscle-Invasive Bladder Cancer
整体思路
结果解读
1.分子分型的构建
作者从肿瘤相关巨噬细胞（Tumor associated macrophages, TAMs）入手，用
组织中CD68代表总巨噬细胞的浸润，CD68+HLA-DR代表M1巨噬细胞，CD206(MRC1）代表M2表达。用X-tile工具将临床标本分为TAMlow, TAMhigh&M2/M1low, TAM high&M2/M1high共3个亚组。
Supplementary Figure1
并在外部数据集中，验证了这个分组的重要性。
Fig.1
Fig.2
Supplementary Figure2
既然这个分型这么重要，那么它是怎么牛的呢？接下来对分型周边进行分析。
2.分子分型周边
2.1免疫细胞浸润+免疫因子
Fig.3
2.2 与其他分子分型比较+免疫治疗反应
Fig.4
Supplementary Figure 3
Supplemenatary Figure 4
体会
1.本文从TAMs及M2/M1入手，联合临床样本验证分型的可靠性，思路非常清晰，可以直接迁移到其他肿瘤，值得借鉴。
2.不只M2/M1，其实CD4/CD8也可以这样去分型。
3.免疫细胞浸润分析部分相对比较丰富，可以借鉴的其他免疫分析中。
参考链接：
Infiltration and Polarization of Tumor-associated Macrophages Predict Prognosis and Therapeutic Benefit in Muscle-Invasive Bladder Cancer
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