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Python数模笔记-NetworkX(2)最短路径

Python数模笔记-NetworkX(2)最短路径

作者: youcans | 来源:发表于2021-05-17 20:23 被阅读0次

    1、最短路径问题的常用算法

    最短路径问题是图论研究中的经典算法问题,用于计算图中一个顶点到另一个顶点的最短路径。

    1.1 最短路径长度与最短加权路径长度

    在日常生活中,最短路径长度与最短路径距离好像并没什么区别。但在具体的图论问题中却可能是不同的概念和问题,经常会被混淆。

    图论中有无权图和有权图,无权图中的边没有权,赋权图的边带有权,可以表示距离、时间、费用或其它指标。在问题文字描述中,往往并不直接指出是无权图还是有权图,这时就要注意最短路径与最短加权路径的区别。路径长度是把每个顶点到相邻顶点的长度记为 1,而不是指这两个顶点之间道路的距离——两个顶点之间的道路距离是连接边的权(weight)。通俗地说,路径长度可以认为是飞行棋的步数,或者公交站点的站数,相邻顶点之间为一步,相隔几个顶点就是几站。路径长度是从路径起点到终点的步数,计算最短路径是要计算从起点到终点步数最小的路径。

    如果问题不涉及顶点之间的距离,要求从起点到终点的最短路径及对应的最短长度,是指从这条路线从起点到终点有几站,在图论中称为最短路径长度。但是,如果问题给出顶点之间的道路长度或距离,姑且称为各路段的距离,要求从起点到终点的最短路径及对应的最短距离,显然并不是在找经过最少步数的路径,而是在找路径中各路段的距离之和最小的路径,在图论中称为最短加权路径长度——这里权重是路段距离。
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    1.2 最短路径的常用算法

    求解最短路径长度的常用算法是 Dijkstra 算法、Bellman-Ford 算法和Floyd 算法,另外还有启发式算法 A*。

    • Dijkstra 算法

    Dijkstra 算法用于计算有权图中最短路径问题 。该算法从起点开始,采用贪心法策略,每次遍历到起点距离最近且未访问过的顶点的邻接节点, 直到扩展到终点为止。

    Dijkstra 算法的时间复杂度为 O(n^2)。如果边数远小于 n^2,可以用堆结构将复杂度降为O((m+n)log(n))。

    Dijkstar算法不能处理负权边。

    • Bellman-Ford 算法

    Bellman-Ford 算法用于求解单源最短路径问题。算法原理是对图进行 V-1次松弛操作,得到所有可能的最短路径。

    Bellman-Ford 算法的时间复杂度高达 O(V*E),V、E 分别是顶点和边的数量。

    Bellman-Ford 算法可以处理负权边。其基本操作“拓展”是在深度上搜索,而“松弛”操作则在广度上搜索,因此可以对负权边进行操作而不影响结果。

    • Floyd 算法

    Floyd 算法又称插点法,利用动态规划思想求解有权图中多源点之间最短路径问题。算法从图的带权邻接矩阵开始,递归地进行 n 次更新得到图的距离矩阵,进而可以得到最短路径节点矩阵。

    Floyd 算法的时间复杂度为 O(n^3),空间复杂度为 O(n^2)。算法时间复杂度较高,不适合计算大量数据。Floyd 算法的优点是可以一次性求解任意两个节点之间的最短距离,对于稠密图的效率高于执行 V 次 Dijkstra算法。

    Floyd 算法可以处理负权边。

    • A* 算法

    A*算法是一种静态路网中求解最短路径最有效的直接搜索方法。

    A*算法是启发式算法,采用最好优先(Best-first)搜索策略,基于估价函数对每个搜索位置的评估结果,猜测最好的位置优先进行搜索。

    A*算法极大地减少了低质量的搜索路径,因而搜索效率很高,比传统的路径规划算法实时性更高、灵活性更强;但是,A*算法找到的是相对最优路径,不是绝对的最短路径,适合大规模、实时性高的问题。

    1.3 最短路径算法的选择

    1. 需要求解任意两个节点之间的最短距离,使用 Floyd 算法;
    2. 只要求解单源最短路径问题,有负权边时使用 Bellman-Ford 算法,没有负权边时使用 Dijkstra 算法;
    3. A*算法找到的是相对最优路径,适合大规模、实时性高的问题。

    2、NetworkX 中的最短路径算法

    2.1 无向图和有向图的最短路径求解函数

    函数 功能
    shortest_path(G[, source, target, weight,...]) 计算图中的最短路径
    all_shortest_paths(G, source, target[,...]) 计算图中所有最短的简单路径
    shortest_path_length(G[, source, target, ...]) 计算图中的最短路径长度
    average_shortest_path_length(G[, weight, method]) 计算平均最短路径长度

    2.2 无权图最短路径算法

    函数 功能
    single_source_shortest_path(G, source[,cutoff]) 计算从源到所有可达节点的最短路径
    single_source_shortest_path_length(G,source) 计算从源到所有可达节点的最短路径长度
    single_target_shortest_path(G, target[,cutoff]) 计算从所有可达节点到目标的最短路径
    single_target_shortest_path_length(G,target) 计算从所有可达节点到目标的最短路径长度
    all_pairs_shortest_path(G[, cutoff]) 计算所有节点之间的最短路径
    all_pairs_shortest_path_length(G[, cutoff]) 计算所有节点之间的最短路径长度

    2.3 有权图最短路径算法

    函数 功能
    dijkstra_path(G, source, target[, weight]) 计算从源到目标的最短加权路径
    dijkstra_path_length(G, source, target[,weight]) 计算从源到目标的最短加权路径长度
    all_pairs_dijkstra_path(G[, cutoff, weight]) 计算所有节点之间的最短加权路径
    all_pairs_dijkstra_path_length(G[, cutoff,... ]) 计算所有节点之间的最短加权路径长度
    bellman_ford_path(G, source, target[, weight]) 计算从源到目标的最短路径
    bellman_ford_path_length(G, source, target) 计算从源到目标的最短路径长度
    all_pairs_bellman_ford_path(G[, weight]) 计算所有节点之间的最短路径
    all_pairs_bellman_ford_path_length(G[,weight]) 计算所有节点之间的最短路径长度
    floyd_warshall(G[, weight]) 用 Floyd 法计算所有节点之间的最短路径长度
    floyd_warshall_numpy(G[, nodelist, weight]) 用 Floyd 法计算所有指定节点之间的最短路径长度

    3、NetworkX 中的 Dijkstra 算法

    NetworkX 中关于 Dijkstra 算法提供了 13 个函数,很多函数的功能是重叠的。这里只介绍最基本的函数 dijkstra_path() 和 dijkstra_path_length()。

    3.1 dijkstra_path() 和 dijkstra_path_length() 使用说明

    dijkstra_path() 用于计算从源到目标的最短加权路径,dijkstra_path_length() 用于计算从源到目标的最短加权路径长度。

    dijkstra_path(G, source, target, weight='weight')

    dijkstra_path_length(G, source, target, weight='weight')

    主要参数:

    • G(NetworkX graph):图。
    • source (node):起点。
    • target (node):终点。
    • weight (string or function):参数为字符串(string)时,按该字符串查找边的属性作为权重;如果该字符串对应的边属性不存在,则权重置为1;参数为函数时,边的权重是函数的返回值。

    返回值:
    dijkstra_path() 的返回值是最短加权路径中的节点列表,数据类型为list。
    dijkstra_path_length() 的返回值是最短加权路径的长度(路径中的边的权重之和),数据类型为 number。

    3.2 dijkstra_path() 算法使用例程

    本案例问题来自:司守奎、孙兆亮,数学建模算法与应用(第2版),P43,例4.3,国防工业出版社。

    例4.3:无向图的最短路问题。已知如图的有权无向图,求顶点 v1 到 顶点 v11 的最短路径。

    # networkX_E2.py
    # Demo of shortest path with NetworkX
    # Copyright 2021 YouCans, XUPT
    # Crated:2021-05-18
    
    import matplotlib.pyplot as plt # 导入 Matplotlib 工具包
    import networkx as nx  # 导入 NetworkX 工具包
    
    # 问题 2:无向图的最短路问题(司守奎,数学建模算法与应用,P43,例4.3)
    G2 = nx.Graph()  # 创建:空的 无向图
    G2.add_weighted_edges_from([(1,2,2),(1,3,8),(1,4,1),
                                (2,3,6),(2,5,1),
                                (3,4,7),(3,5,5),(3,6,1),(3,7,2),
                                (4,7,9),
                                (5,6,3),(5,8,2),(5,9,9),
                                (6,7,4),(6,9,6),
                                (7,9,3),(7,10,1),
                                (8,9,7),(8,11,9),
                                (9,10,1),(9,11,2),
                                (10,11,4)])  # 向图中添加多条赋权边: (node1,node2,weight)
    # 两个指定顶点之间的最短加权路径
    minWPath_v1_v11 = nx.dijkstra_path(G2, source=1, target=11)  # 顶点 0 到 顶点 3 的最短加权路径
    print("顶点 v1 到 顶点 v11 的最短加权路径: ", minWPath_v1_v11)
    # 两个指定顶点之间的最短加权路径的长度
    lMinWPath_v1_v11 = nx.dijkstra_path_length(G2, source=1, target=11)  #最短加权路径长度
    print("顶点 v1 到 顶点 v11 的最短加权路径长度: ", lMinWPath_v1_v11)
    
    pos = nx.spring_layout(G2)  # 用 FR算法排列节点
    nx.draw(G2, pos, with_labels=True, alpha=0.5)
    labels = nx.get_edge_attributes(G2,'weight')
    nx.draw_networkx_edge_labels(G2, pos, edge_labels = labels)
    plt.show()
    # === 关注 Youcans 原创系列(https://www.jianshu.com/u/5df8372991c5)
    

    3.3 程序运行结果

    顶点 v1 到 顶点 v11 的最短加权路径:  [1, 2, 5, 6, 3, 7, 10, 9, 11]
    顶点 v1 到 顶点 v11 的最短加权路径长度:  13
    
    networkX_04.png

    3.4 程序说明

    1. 图的输入。本例为稀疏的有权无向图,使用 G.add_weighted_edges_from() 函数可以使用列表向图中添加多条赋权边,每个赋权边以元组 (node1,node2,weight) 表示。
    2. 图的绘制。使用nx.draw()绘图时,默认的节点位置可能并不理想,nx.spring_layout() 使用 Fruchterman-Reingold 力定向算法定位节点。
    3. 绘制边的属性。使用 nx.draw_networkx_edge_labels() 可以绘制边的属性,例程中选择显示权重属性。

    4、NetworkX 中的 Bellman-Ford 算法

    NetworkX 中关于 Bellman-Ford 算法提供了 13 个函数,很多函数的功能是重叠的。这里只介绍最基本的函数 bellman_ford_path() 和 bellman_ford_path_length()。

    4.1 bellman_ford_path() 和 bellman_ford_path_length() 使用说明

    bellman_ford_path() 用于计算从源到目标的最短加权路径,bellman_ford_path_length() 用于计算从源到目标的最短加权路径长度。

    bellman_ford_path(G, source, target, weight='weight')

    bellman_ford_path_length(G, source, target, weight='weight')

    主要参数:

    • G(NetworkX graph):图。
    • source (node):起点。
    • target (node):终点。
    • weight (string):按字符串查找边的属性作为权重。默认值为权重 'weight'。

    返回值:
    bellman_ford_path() 的返回值是最短加权路径中的节点列表,数据类型为list。
    bellman_ford_path_length() 的返回值是最短加权路径的长度(路径中的边的权重之和),数据类型为 number。

    4.2 bellman_ford_path() 算法使用例程

    本案例问题来自:司守奎、孙兆亮,数学建模算法与应用(第2版),P41,例4.1,国防工业出版社。

    例4.1:城市间机票价格问题。已知 6个城市之间的机票票价如矩阵所示(无穷大表示没有直航),求城市 c1 到其它城市 c2...c6 的票价最便宜的路径及票价。

    # networkX_E1.py
    # Demo of shortest path with NetworkX
    # Copyright 2021 YouCans, XUPT
    # Crated:2021-05-18
    
    import pandas as pd
    import matplotlib.pyplot as plt # 导入 Matplotlib 工具包
    import networkx as nx  # 导入 NetworkX 工具包
    
    # 问题 1:城市间机票价格问题(司守奎,数学建模算法与应用,P41,例4.1)
    # # 从Pandas数据格式(顶点邻接矩阵)创建 NetworkX 图
    # # from_pandas_adjacency(df, create_using=None) # 邻接矩阵,n行*n列,矩阵数据表示权重
    dfAdj = pd.DataFrame([[0, 50, 0, 40, 25, 10],  # 0 表示不邻接,
                          [50, 0, 15, 20, 0, 25],
                          [0, 15, 0, 10, 20, 0],
                          [40, 20, 10, 0, 10, 25],
                          [25, 0, 20, 10, 0 ,55],
                          [10, 25, 0, 25, 55, 0]])
    G1 = nx.from_pandas_adjacency(dfAdj)  # 由 pandas 顶点邻接矩阵 创建 NetworkX 图
    
    # 计算最短路径:注意最短路径与最短加权路径的不同
    # 两个指定顶点之间的最短路径
    minPath03 = nx.shortest_path(G1, source=0, target=3)  # 顶点 0 到 顶点 3 的最短路径
    lMinPath03 = nx.shortest_path_length(G1, source=0, target=3)  #最短路径长度
    print("顶点 0 到 3 的最短路径为:{},最短路径长度为:{}".format(minPath03, lMinPath03))
    # 两个指定顶点之间的最短加权路径
    minWPath03 = nx.bellman_ford_path(G1, source=0, target=3)  # 顶点 0 到 顶点 3 的最短加权路径
    # 两个指定顶点之间的最短加权路径的长度
    lMinWPath03 = nx.bellman_ford_path_length(G1, source=0, target=3)  #最短加权路径长度
    print("顶点 0 到 3 的最短加权路径为:{},最短加权路径长度为:{}".format(minWPath03, lMinWPath03))
    
    for i in range(1,6):
        minWPath0 = nx.dijkstra_path(G1, source=0, target=i)  # 顶点 0 到其它顶点的最短加权路径
        lMinPath0 = nx.dijkstra_path_length(G1, source=0, target=i)  #最短加权路径长度
        print("城市 0 到 城市 {} 机票票价最低的路线为: {},票价总和为:{}".format(i, minWPath0, lMinPath0))
    
    # nx.draw_networkx(G1) # 默认带边框,顶点标签
    nx.draw(G1, with_labels=True, layout=nx.spring_layout(G1))
    plt.show()
    # === 关注 Youcans 原创系列(https://www.jianshu.com/u/5df8372991c5)
    

    4.3 程序运行结果

    顶点 0 到 3 的最短路径为:[0, 3],最短路径长度为:1
    顶点 0 到 3 的最短加权路径为:[0, 4, 3],最短加权路径长度为:35
    城市 0 到 城市 1 机票票价最低的路线为: [0, 5, 1],票价总和为:35
    城市 0 到 城市 2 机票票价最低的路线为: [0, 4, 2],票价总和为:45
    城市 0 到 城市 3 机票票价最低的路线为: [0, 5, 3],票价总和为:35
    城市 0 到 城市 4 机票票价最低的路线为: [0, 4],票价总和为:25
    城市 0 到 城市 5 机票票价最低的路线为: [0, 5],票价总和为:10
    
    networkX_05.png

    4.4 程序说明

    1. 图的输入。使用 pandas 中 DataFrame 读取数据文件非常方便,本例中以 pandas 输入顶点邻接矩阵,使用 nx.from_pandas_adjacency(dfAdj) 转换为 NetworkX 的图。
    2. 邻接矩阵。邻接矩阵 dfAdj (i,j) 的值表示连接顶点 i、j 的边的权值, i、j 不相邻 dfAdj (i,j) =0, 本例中表示没有直航。
    3. 最短路径与最短路径长度。nx.shortest_path() 返回最短路径。nx.shortest_path_length() 返回最短路径长度,本例中可以理解为从起点到终点的乘机次数,1 表示直航,2 表示中转一次。
    4. 最短加权路径长度。nx.bellman_ford_path_length() 返回最短加权路径长度,本例中权重为票价,最短加权路径长度即为两点间最便宜的直航或中转的机票票价。
      通过本案例,可以直观地理解最短路径长度与最短加权路径长度的区别。

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    Python数模笔记-NetworkX(1)图的操作
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    版权说明:

    本文内容及例程为作者原创,并非转载书籍或网络内容。
    本文中案例问题来自:
    1、司守奎、孙兆亮,数学建模算法与应用(第2版),国防工业出版社。

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