取子集

[section 1] step03-提取单细胞亚群子集_哔哩哔哩_bilibili 2分钟开始

R里面取子集可以根据，逻辑值 或者 是坐标 取。

逻辑值 是判断要不要取，坐标是告诉他取哪个坐标

cd4_sce1 = sec [,sce@metadata$seurat_clusters %in% c(0,2)]  # 逻辑值
cd4_sce2 = sec [, Idents(sce) %in% c("Naive CD4T","Memory CD4T")]  # 和上面的效果一样
# subset 函数也可以

Seurat4.0系列教程5：交互技巧 - 简书 (jianshu.com)
Seurat取子集时会用到的函数和方法 - 简书 (jianshu.com)
单细胞seurat中提取细胞子集 - 简书 (jianshu.com)
Seurat Weekly NO.2 || 我该如何取子集？ - 简书 (jianshu.com)
单细胞数据处理小细节汇总 - 简书 (jianshu.com)