学习小组Day6笔记-行

作者: 奔跑的羽蒙 | 来源:发表于2020-03-18 22:57 被阅读0次

    学习R包

    安装和载入R包

    1、镜像配置的高级方式
    配置Rprofile文件,配置完成后保存重启即可。

    file.edit('~/.Rprofile') #编辑文件
    options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
    options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
    

    2、安装
    install.packages(“包”)BiocManager::install(“包”)
    3、载入
    library()require()

    dplyr包学习

    五个基础函数
    新增列 mutate()
    筛选列 select()
    筛选行 filter()
    表格排序 arrange()
    汇总 summarise()

    内置数据集:R内置了大量数据集和案例,这样在学习的时候,无需自己去找数据集,就可以根据案例来进行操作。下面的示例数据直接使用内置数据集iris。
    %in% :x %in% y 的意思是“对x里的每个元素进行判断,判断它是否在y中存在,存在就返回TRUE,不存在就返回FALSE”。

    test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
    mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) #新增列
    select(test,1) #筛选第一列  
    select(test,c(1,5)) #筛选第一列和第五列
    select(test,Sepal.Length) #筛选Sepal.Length列
    filter(test, Species == "setosa") #筛选species列为setosa的行
    filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )# 筛选species列为setosa,length>5的行
    filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor")) #筛选species列存在setosa和versicolor的行
    arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序
    arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小
    summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差
    
    dplyr两个实用技能

    %>% : 管道符号,表示前一句代码的输出作为后一句代码的输入,查看https://www.jianshu.com/p/5a5e2fe99cd2。快捷键 cmd/ctr + shift + M。

    1、管道操作

    test %>% 
      group_by(Species) %>% 
      summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
    

    2、统计某列的unique值
    count(test,Species)

    dplyr处理关系数据

    a. 內连
    inner_join(test1, test2, by = "x")
    基于x的连接只保留共同的数据
    b. 左连
    left_join(test1, test2, by = 'x')
    只保留了test1的x对应的数值,当相应的值不存在的时候,用NA代替;
    c. 全连
    full_join( test1, test2, by = 'x')
    全连保留了所有x对应的数据,当相应的值不存在的时候,用NA代替
    d. 半连接
    semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')
    返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
    e. 反连接
    anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')
    返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
    f. 简单合并
    bind_rows(test1, test2)

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