BIOGPS

作者: JeremyL | 来源:发表于2018-03-21 23:38 被阅读153次

BIOGPS

A free extensible and customizable gene annotation portal, a complete resource for learning about gene and protein function.

如果你想快速了解一个基因,BIOGPS或许是一个不错的选择

进入首页:

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首页就是就可以直接搜索基因

  • BioGPS支持各种基因标识符的搜索,Entrez Gene, Ensembl, Refseq, Affymetrix等都是可以的;
  • BioGPS支持基因标识符的模糊搜索,例如:cdk*,cdk?;
  • BioGPS也支持批量基因搜索,输入基因列表即可。

搜索:

输入基因CDK2搜索

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搜索结果:

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根据搜索名称可能得到一些基因列表,从中选择自己要关注的基因名称以及物种;

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基因注释结果是默认布局

  • 版块1是一些重要的基因信息的注释,并且还有与其他数据的链接;

  • 版块2是基因在不同组织细胞中的表达情况;

  • 版块3是基因的wiki主页;

  • 选项4可以选择调整结果页面展示不同的信息。

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使用指导:

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使用指导中介绍了四个方面,还有相关的视频教程;

  1. Search for your gene of interest
    Watch the Screencast: Searching in BioGPS (1:58)

  2. View the gene annotation report
    Watch the Screencast: View the standard gene report (2:18)

  3. Browse the gene report layouts
    Watch the Screencast: Tour the default layouts (2:44)

  4. Build your own gene report
    Watch the Screencast: Customizing gene report layouts (3:24)

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