细菌是有情，这在佛经里很早就讲过。佛曾经讲过：“一杯水里面有八万四千众生。”佛有规定：所有比丘都要带一个滤水囊，当他们到野外喝水时，水一定要先过滤。以前的人肠胃健康，有虫无虫都照喝，水中的细虫喝下去也会变成营养，现在的人喝下去就会拉肚子。以前的人，喝生水是很平常的，所以出门要带滤水囊，用布囊先把水滤过再喝。因为水里有小虫，如果吃掉，就是杀生。
可是 佛又说，一杯水滤过后，还有八万四千众生在。就是指细菌。那些细菌也是众生，也是有情，因此也有如来藏。
细菌为什么是有情呢？医学家用一些药来试验，同一批细菌，用一种它们没接触过的药放进去，这些细菌会过来接触，接触后赶快游开；第二次再把它们放进去，它们都懂得躲开，不会再接触后才离开；这表示它们也有简单的记忆，既然有记忆，那一定是有情！植物不会懂得要躲开，植物不会有讨厌或喜欢的情绪，只是随着因缘漂流发展而已。
细菌是有情，只是它的五根功能不像我们人类众生一样，跟我们这种比较高级的众生不同，它是低级的众生，只能作简单的了别，但还是有觉知、有意识心。如果没有意识，就无法做这个分别：“这个我经验过了，是使我难过的东西，我得赶快跑开！”它虽然不会用语言这样想，但是它会远离不喜欢的物质，它有简单的记忆，这个现象已被医学家证明。
再换一种细菌没接触过的药品，放进去时它又会过来接触，接触以后发觉不好，又会跑开了。可见它能作简单的分别：“这个物质和上次的东西不一样，我要试探一下是什么？是不是可以吃？”所以它虽然没有语言文字，却一样可以分别。既然可以分别境界，当然就是有情。所以细菌也是有情。
有的人造大恶业，譬如谤法、谤贤圣、无根诽谤凡夫僧；或者更严重的人，他因为私心而暗中破坏正法的弘传等，舍寿时下了地狱，如果在世时又没有修集过什么福德的话，将来会辗转投生为细菌。当他投生为细菌时，还是有情的一种，仍有简单的喜怒哀乐。如果是破坏正法的人，就算是生前修得了般若智慧与大神通，当他生到地狱受苦多劫，然后又要很多劫辗转受生为低级生物的时候，由于意识心很低劣的缘故，所以他的智慧与大神通也都跟着消失了；所以神通并不可靠，证得般若智慧以后，如果因为私心而破坏正法的弘传，般若智慧也救不了他！这就是说：五浊恶世的众生，悟得般若智慧以后，如果没有谨守戒律，还是会失去的。纵使已经修到十回向位，一旦犯了破坏正法、诽谤地上胜义僧的重戒等，都会失去一切修证。在《菩萨璎珞本业经》里面，佛曾经说过：“三贤（位及）十地（位的修证）一切皆失。”所以要很小心，千万要记得：以戒为师。否则，将来生到细菌中去的时候，都忘了自己是怎么会生为细菌的！
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