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windows中通过命令行执行R命令——Batch Proces

windows中通过命令行执行R命令——Batch Proces

作者: 拓端tecdat | 来源:发表于2016-09-12 23:56 被阅读467次

    在很多情况下,我们需要在外部环境中直接调用软件来执行某个脚本,而不需要进入软件的交互界面,这样被称为非交互方式,通过这种方式可以方便快捷地执行脚本语句达到输出结果的目的。r软件也不例外,外部调用有很多方法,其中一种被称为 Batch Processing的方法,可以通过windows或者linux中的CMD运行脚本然后将结果传送输出到另一个out文件。下面举例说明。

    首先到系统高级设置中配置r为环境变量

    path=D:\R-3.3.0\bin;

    在path中添加r.exe文件所在目录

    然后通过cmd调用脚本语句,两个平台的格式分别为:

    # on Linux

    RCMD BATCH [options] my_script.R [outfile]

    # on Microsoft Windows (adjust the path to R.exe as needed)

    "C:\Program Files\R\R-2.13.1\bin\R.exe" CMD BATCH

    --vanilla --slave "c:\my projects\my_script.R"

    在windows中打开命令行界面

    输入命令"C:\Program Files\R\R-2.13.1\bin\R.exe" CMD BATCH

    --vanilla --slave "c:\my projects\my_script.R"

    其中"C:\Program Files\R\R-2.13.1\bin\R.exe"为r的软件目录

    "c:\my projects\my_script.R"为执行文件的目录

    运行后,cmd会将输出结果传输到文件目录的out文件中

    值得注意的是,out文件中会记录下console中所有出现的输出数据

    同时会记录下文件执行时间

    对比rstudio界面中的输出语句

    相对于r交互中的输出,值得注意的几点:

    1.输出看起来就像R是交互式地运行的。

    2.输出结果中的参数多了一些。

    3.最后有一个运行总结,显示运行脚本花费的时间。

    另外一方面,当脚本无法正常执行时,同样会输出out报告错误原因

    因此对于网站的日常运营来说,用这种方式不仅方便快捷,并且可以记录下过程输出和运行总结,可以作为log日志报告文件来使用。

    原文请浏览官网

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