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R语言安装包下载相关问题

R语言安装包下载相关问题

作者: 花舞lala | 来源:发表于2020-08-13 17:32 被阅读0次

    1.设置CRAN镜像

    options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")
    

    2.安装BiocManager

    if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
      install.packages("")
    BiocManager::install(version = "3.12")
    

    注意:BiocManager与Rstudio版本的对应关系,version = "3.12"适用于Rstudio4.0以上的版本
    2.1 BiocManager安装R包

    BiocManager::install("GEOquery")
    

    2.2联网问题

    ## 打不开的  options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
    
    连接打不开,所以直接用默认的会比较好

    3 无法联网,配置网络

    options(download.file.method = 'libcurl')#第一种
    
    options(download.file.method = 'libcurl')#第二种
    options(url.method='libcurl')
    

    4 批量安装R包,由于依赖包的关系,出现错误。
    实在安装不上的就手动安装啦


    搜索R包名称,推荐使用bing搜索
    选择相应的版本进行下载,推荐Motrix或迅雷下载
    点击Rstudio的install
    选择完成后点击install,等待安装即可

    我的问题是下载R包显示无法联网,试了很多方法,换了多个镜像也不可以,最后直接重装Rstudio按照上述的版本就可以了。不过下载速度还是有些慢,还有部分无法安装的就直接手动安装了。

    还有就是由多个依赖包的时候,根据提示就缺啥补啥啦。

    弄了好久,有点心塞,允悲。

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