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生信星球学习小组第80期 Day2笔记--ZJUSKY

生信星球学习小组第80期 Day2笔记--ZJUSKY

作者: ZJUSKY | 来源:发表于2020-09-15 16:29 被阅读0次

    Linux简介

    Linux和常见的windows系统一样,都是一种操作系统。不同之处在于windows在个人PC中更为普及,可视化程度较好,它将冷冰冰的代码转换为了更易上手和学习的图标,对于大多数人的日常办公娱乐是足够的。而为什么要学习Linux,对于生信行业,它具有很多优点,例如有很多windows中没有的软件,处理大型数据更稳定快速等。

    Linux 基本操作

    安装Linux

    如果你没有服务器,但是有一台Windows 10的笔记本,那么恭喜你,可以直接在你的笔记本上使用Linux了,只需要自行搜索安装Linux即可,非常方便,具体我就不展示了。下面用云服务器上的Linux来展示。

    登录云服务器(以Windows为例)

    首先需要下载Xshell(用来远程连接服务器),然后输入账号,密码和ip地址,当然还有一件事别忘记,因为是云服务器,所以一定要联网。。。
    在Xshell中输入ssh 用户名@ip地址,然后输入密码即可。

    Linux基础命令

    1.pwd

    pwd: print working directory,显示当前路径。


    /home/bio01 就是我的当前路径

    2.mkdir

    mkdir: make directory,创建目录

    3.ls

    ls: list file,显示当前工作目录下的文件和目录。
    结合上面的命令,显示效果如下

    4.rm

    rm: remove,删除文件或者目录
    ·删除文件:rm 文件名
    ·删除空目录:rmdir 文件名
    ·删除非空目录:rm -r 文件名
    \color{red}{切记不要使用`rm-rf`后面不加目录名,否则会删除服务器的所有东西。}

    5.cd

    cd: change directory,切换当前工作目录。
    cd :接一个目录,表示进入该目录
    cd - :返回刚才目录
    cd :主目录,相当于手机中的home键
    练习cd操作:进入tmp目录,然后查看当前路径,然后返回主目录


    练习删除操作:
    • 删除doodle.txt

    • 删除整个huahua目录

    • 删除rm_rest(已经是空目录了)


    6. vi

    vi:新建脚本或文本文档。

    cd tmp
    vi 1.txt
    #切换到英文输入法后,点击i,就可以输入文本了
    #ESC键,退出编辑模式
    :x  #保存并退出
    

    7. cat

    cat接文本文件的名字,可以直接将其内容输出到屏幕,按q可以退出cat
    head默认输出前10行,tail默认输出后10行,后面加上-n自定义输出几行
    例如:head -n 2 1.txt

    8.cp

    cp: copy,复制文件。
    cp file1 file2:复制file1,命名为file2。

    9.mv

    mv: move file,移动文件夹或者重命名。
    mv file 路径:移动file到某路径下
    mv file1 file2将file1 重命名为file2.

    总结 思维导图

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