GD.so: undefined symbol: Perl_Gt

超折腾人的报错

perl: symbol lookup error: perl_modules/lib/auto/GD/GD.so: undefined symbol: Perl_Gthr_key_ptr

题记：用circos画图时莫名的出现这样消除不了的报错，怎么找也找不到原因，现给出解决方法如下

1. 咋一看是Perl缺少模块的问题，于是去装Perl的GD模块
   https://github.com/lstein/Perl-GD
   结果发现装了之后还是和之前一样的，并没有这个GD.so模块
2. 仔细阅读官网，出现这一句：

"Fatal error: can't load module GD.so", or "Fatal error: unknown
symbol gdFontSmall" when you try to run a script that uses GD, you may
have problems with dynamic linking.  Check whether other
dynamically-linked Perl modules such as POSIX and DB_File run
correctly.  If not, then you'll have to link Perl statically, as
described above.  Other problems may be fixed by compiling libgd as a
shared library, as described in step (2) of the installation
instructions.

这应该是说明根本就没有这个 GD.so模块，但是我又没有软连接，只有很多Perl5的环境变量，于是去排查Perl5的环境变量

3. export PERL5LIB的环境变量有很多，于是去打算注释几个
   关键是source ~/.bashrc之后还是会出现原来的perl_modules/lib/auto/GD/GD.so: undefined symbol: Perl_Gthr_key_ptr路径，这个我是注释了的，怎么还是调用了呢？
4. 请教之后发现需要退出登录，才能生效，保留模块完整的不冲突的perl_modules路径export PERL5LIB=/perl_module/perl_modules/lib:$PERL5LIB，注释掉conda的自启动，退出远程帐户再登录才生效！！！

跑转录组blast.kegg.process.sh时也出现了这样的Perl 模块报错，同时得到解决。

perl: symbol lookup error: /software/perl_module/perl_modules/lib/auto/GD/GD.so: undefined symbol: Perl_Gthr_key_ptr
blast.kegg.process.sh.e4149563 (END)

总结：在确认已经有完整的Perl模块的时候，并不是缺少模块，而是怀疑环境变量的perlLIB是不是有冲突，注释掉冲突的perlLIB以及conda，退出再生效，可以解决此类问题