2019.10.15
勤奋,很好的研究,更好的生活。
Perl 变量、循环、替换
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
1. 数组:很多数构成向量,用@表示,可循环运算
$、@变量
2. 文本文件:一行一行换一行,类似于用Notepad打开,word中的不是
3. sqs数组:ppt中第60页,每一行包括换行符,数组从0开始,0对应第一行
4. 序列就是字符串,字符串包括> \n\n换行几次
5. \s 代表广泛的字符,包括空格、换行符、Tab键
\t 相当于Tab键,一般是6个空格
数据库
1. 三大数据库
NCBI 美国国家生物信息中心
EBI 欧洲
DDBJ 日本的DNA数据银行
2. 蛋白质数据库 Pfam(同源蛋白质家族数据库)
3. SRA库 高通量测序
4. NP 拼接问题,测序测的短,拼接很难
5. scaffolds (序列)
6. 毛古杨的全基因组是Phytozome中的Assembly中。
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