美文网首页
Ubuntu R 运行bedr报错 ERROR: missin

Ubuntu R 运行bedr报错 ERROR: missin

作者: 煮梦斋_bioinfo | 来源:发表于2022-07-31 14:24 被阅读0次

    Ubuntu中R调用bedr报错ERROR: missing binary/executable bedtools,发现bedr依赖于bedtools,需要先安装bedtools,然后在R中再安装bedtoolsr

    1. https://github.com/arq5x/bedtools2/releases中下载最新的bedtools的zip文件
    2. 解压
    3. 进入文件夹 cd src/bedtools2-2.30.0
     sudo make
     sudo make install
    
    1. https://github.com/PhanstielLab/bedtoolsr中下载最新版本的bedtoolsr的zip文件
    2. 解压
    3. 进入R界面
    4. 本地安装bedtoolsr
    install.packages("/path/to/bedtoolsr-2.30.0-2", type="source", repos=NULL)
    

    相关文章

      网友评论

          本文标题:Ubuntu R 运行bedr报错 ERROR: missin

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/rqdrwrtx.html