交互式进程查看器——htop

除了管理员，大多数使用者往往不会去看自己的程序占用了多少资源，也不会关注自己是否会把公用的资源用完。考虑到很少有人有自己的服务器，因此我强烈建议所有生信人学会对自己进程进行管理。

之前刚接触服务器的时候，我还不太会看自己使用资源的情况，直到我使用hisat2比对的时候把服务器的资源（线程）全占满了【Linux||你的服务器怎么一片绿？】，我才开始去了解。

今天给大家推荐一个交互式进程查看器——htop。

事实上，我在之前的推文里有提到过top【Linux||后台运行及查看状态命令】，但我几乎不用。最近才发现，身边做生信的往往不太知道htop这个好用的工具。

Htop是一款运行于Linux系统监控与进程管理软件，用于取代Unix下传统的top。[1]

与top只提供最消耗资源的进程列表不同，htop提供所有进程的列表，并且使用彩色标识出处理器、swap和内存状态。

用户一般可以在top无法提供详尽系统信息的情况下选择安装并使用htop。比如，在查找应用程序的内存泄漏问题时。与top相比，htop提供更方便、光标控制的界面来杀死进程。

安装

htop的安装非常简单，使用conda即可。由于htop经常使用，我建议安装在base环境下。

conda install -y htop

界面

安装好后，输入htop按回车即可查看进程，按F10或q可退出。

htop的界面基本可以分为三部分。

• 1代表资源占用情况和服务器运行情况，主要显示了CPU（线程数）、物理内存和交换分区的信息，以及任务数量、平均负载和连接运行时间等信息。

如图中显示，一共有12个线程，0个线程被占用；一共有126G物理内存，3.35G被占用；共有186个任务，一个正在运行等。

• 2为进程区域，显示了当前系统中的所有进程，其中包括命令的的PID、占用资源情况、运行时间和具体命令。

• 3为操作提示区，显示了当前界面中F1-F10功能键中定义的快捷功能。

如图中显示，F1为帮助文档，F10为退出。

使用

这里我只分享我最常用的几个操作。在我的日常中，htop往往充斥着运行前、运行时和运行后。

运行程序前

在运行程序前，通过htop看看服务器目前的资源使用情况，避免出现和其他人发生冲突，使服务器处于过载的情况。这时只需要直接输入htop即可，另外点击任意参数都可以进行排序，如CPU、MEM等。

运行程序时

在运行程序时，通过htop查看命令是否正常运行，通常显示CPU或内存被占用就默认正常运行。

比如我要将程序命令放在后台，nohup command &回车后，输入htop，再按u即可选择用户，展示特定用户的占用情况，我再输入自己的用户名，就可以看看自己的运行情况啦。

运行程序后

在运行程序后，我会用htop来看看是否会有因各种原因处于休眠状态（没有退出），但仍占用资源的情况。

比如这里就存在休眠的程序，仍然在占用资源，根据自己的需要进行kill。

更多更详细的教程，原作者在youtube上传了视频[2]，大家可以自取。也可以看中文文档htop使用详解--史上最强（没有之一）[3]。

另附，htop官网：https://htop.dev/

htop的github页面：https://github.com/htop-dev/htop

参考资料

[1]维基百科: https://zh.wikipedia.org/wiki/Htop#cite_note-1
[2]Youtube视频: https://youtu.be/L25waVhy78o
[3]htop中文文档: https://cloud.tencent.com/developer/article/1115041