可参考安装流程：https://vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/smrt.htm
遇到问题1

image.png

查找解决方式

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root用户修改了
vim /etc/profile #修改
添加两行
ulimit -n 10240
ulimit -u 10240
source /etc/profile #运行

还是提示一个ERR

ps: 重新安装的话，每一次要把以前生成的文件夹删除掉y
ok
运行

$ cd smrtlink/admin/bin
$ ./services-start
$ ./import-canneddata

遭遇问题

image.png
输入ulimit -u10240 回车
重新 ./services-start
发现如果这样子，也许每次都要输入这个命令了，以后再检查下
参考修改后，重新运行./services-start
https://www.cnblogs.com/tbyang/p/4139884.html

10.0.1.63

SMRT Link Troubleshooting Guide (v6.0.0)

image.png

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contos没有iptables，可能是个原因，试一下
可以试一下
检查是否安装了iptables
service iptables status

参考解决方案：
虚拟机新装了一个CentOs7，然后做防火墙配置的时候找不到iptables文件，解决方法如下：
因为默认使用的是firewall作为防火墙，把他停掉装个iptable
systemctl stop firewalld
systemctl mask firewalld
yum install -y iptables
yum install iptables-services
这些都可以正常运行，很多网页上给的不能运行。
作者：Mr_xie
链接：https://www.jianshu.com/p/4f837428dabc
来源：简书
简书著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者获得授权并注明出处。

vim /etc/sysconfig/iptables 出现了iptables，不错，继续

s

然后，修改/etc/sysconfig/iptables文件，增加5432（PostGresql数据库需要）、9090和8243（软件网页端使用tomcat提供服务时需要9090和8423）端口。在该文件中正确的位置增加如下两行：
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 5432 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 9090 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8243 -j ACCEPT
然后重启防火墙，让修改生效：

/etc/init.d/iptables restart

好像还需要装postgresql-server.x86_64
yum install postgresql-server.x86_64
yum install postgresql postgresql-server

service postgresql initdb
这个没做了

实在没招了，，删掉smrtlink目录，重新装一下，，一路顺风，居然成功了

image.png image.png

总结下，，可能还是得先配置好该做的，然后再装软件。我是先装软件，再配置东西的，这样可能配置不能被软件读取。。以上