第一步，下载TCGA表达量数据
（1）计算不同亚型患者在免疫细胞上的区别 通过ssgsea算法，根据各个免疫细胞上的特征基因，基于患者的表达量数据...
ssGSEA即单样本GSEA分析，主要可以用来量化免疫浸润。 免疫浸润是什么？要是直白的解释就是免疫细胞渗透到肿瘤...
1.目的 要把免疫细胞与某些基因计算相关性，并画出热图，例如（图） 2.思路 其实就是把完整的相关性矩阵切出一部分...
常见的量化免疫细胞浸润的方法： ssGSEA：一般评价28种免疫细胞浸润 Cibersort：由斯坦福大学开发，评...
ssGSEA常用来评价免疫细胞浸润情况，并对ssGSEA结果进行聚类，下面就来汇总下类似的文章，希望能为以后的科研...
目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下...
Deep learning in biology 计算基因组学工具解析肿瘤与免疫细胞的互作 参考：https://...
关于批量相关性分析，我们发过两个帖子。单基因批量相关性分析的妙用又是神器！基于单基因批量相关性分析的GSEA 两两...
需求描述 计算多个基因和免疫浸润的相关性，画出类似于文章中这种热图，用颜色展示相关系数，用**标出显著的。 出自h...
本文标题：计算单基因和免疫细胞相关性（ssGSEA）
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/rxnnaktx.html
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