lncRNA，全称“长链非编码RNA”（long non-coding RNA），是近年来RNA方向的研究热门。
以前只是各种听说，没正儿八经地做过lncRNA的测序分析。最近接到新任务，所以来了解了解，本人实在健忘，所以记下lncRNA的基础信息。
- lncRNA特点？
1）长度在200-100000nt之间的RNA分子；
2）具有mRNA样结构，有polyA尾巴和启动子样结构；
3）不编码蛋白。
在生信分析中，往往会去除
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有蛋白编码家族的转录本；
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去除有编码能力的RNA来筛选lncRNA；（工具：CPAT，CNCI，CPC，PLEK）
- 为什么lncRNA要采用链特异性建库？
熟悉lncRNA测序的朋友们肯定知道，lncRNA测序多采用链特异性建库。其原因为：
1）lncRNA的来源是具有链特异性的；
2）lncRNA来源就是编码蛋白（mRNA）基因的反义链，是传说中的天然反义lncRNA（NAT-antisense lncRNA）；如果是普通非链特异性建库，那么序列是来自mRNA，还是NAT-antisence LncRNA就难以区分了；
3）链特异性建库可更准确地统计转录本的数量和确定基因的结构，准确区分获得的转录本来自基因组哪条链。
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