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ATAC比对率低

ATAC比对率低

作者: 冰美沙拉 | 来源:发表于2022-07-21 20:26 被阅读0次

处理了一批ATAC数据,用bowtie比对后发现比对率只有10-20%,打开原始测序fq文件,截取整条测序reads(大概150bp),去NCBI做blast比对,发现很多reads都比对到了支原体上,可能是细胞支原体污染,导致整个文库被污染了

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