处理了一批ATAC数据,用bowtie比对后发现比对率只有10-20%,打开原始测序fq文件,截取整条测序reads(大概150bp),去NCBI做blast比对,发现很多reads都比对到了支原体上,可能是细胞支原体污染,导致整个文库被污染了
本文标题:ATAC比对率低
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