• Conda相关

linux系统的appStore
花花总结的关于linux系统的app Store，可以参考

uname -a #查看系统版本

然后进入清华的conda镜像网站
查找跟系统版本匹配的文件名称，寻找latest最新版本，然后复制链接。

cd biosoft #进入biosoft文件夹
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ #下载文件

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh  #安装Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

开始了安装过程，中间会出现很多的版权信息，按回车跳过它们

看到一行“Do you accept the license terms? [yes|no]”说明安装要开始了【注意看下图的操作，程序让你enter就enter，让你yes就yes】

Thank you for installing Miniconda3! #看到这句话说明安装conda成功

source ~/.bashrc #激活conda

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

conda list #查看当前服务器安装的所有软件列表

conda search fastqc #搜索fastqc软件，默认路径是biosoft

conda install fastqc -y #安装fastqc软件

conda remove fastqc -y #卸载软件代码

conda info --envs #查看当前环境

• 输出为一个默认环境，base *

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y #新建rna-seq的conda 环境

conda info --envs #安装rna-seq环境后再次查看conda环境

• 输出 base和rna-seq两个环境，再设置rna-seq为默认环境

conda activate rna-seq #j激活rna-seq环境，设置rna-seq为默认环境

• 安装conda环境完毕

• 再根据后面的学习计划进行操作