脑血管内皮细胞亚群细分marker genes

作者: 小熊_wh | 来源:发表于2022-03-09 14:01 被阅读0次

脑血管内皮细胞亚群细分marker genes
AP的预后预测和COVID-19诱发AP相关的研究
单细胞转录组数据分析课件||8. Differential ex
4 单个亚群细分
脑血管相关基因Marker
如何看单细胞（或空间）亚群间关系2022-07-03
单细胞测序细胞类型鉴定
单细胞类型鉴定总结
04.寻找所有亚群的差异基因并输出
Celaref | 单细胞测序细胞类型注释工具

文章来源：A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer's risk

PMID: 35165441

脑血管内皮细胞(brain endothelial cells, BECs) 可分为动脉、毛细血管、静脉三个区域，相应marker基因如下：

## Brain endothelial cells (BECs) markers according to PMID: 35165441
BECs_markers <- c('PECAM1', 'FLT1', # endothelial cells
                  'VEGFC', 'ALPL', # arterial
                  'MFSD2A', 'SLC7A5', # capillary
                  'IL1R1', 'NR2F2' # venous
                  )

脑血管内皮细胞亚群细分marker genes
文章来源：A human brain vascular atlas reveals diverse mediato...
AP的预后预测和COVID-19诱发AP相关的研究
Novel insight on marker genes and pathogenic peripheral n...
单细胞转录组数据分析课件||8. Differential ex
单细胞数据分析中的差异分析主要是找出每个亚群的marker基因，可以作为亚群的某个特性。此处省略SCDE的标准流...
4 单个亚群细分
##########################################细分 library(Seur...
脑血管相关基因Marker
文章来源：Single-cell analysis of the cellular heterogeneity a...
如何看单细胞（或空间）亚群间关系2022-07-03
方法1 umap降维图：亚群间距离越近，越相似方法2 查看cluster间差异分析结果中marker基因，可从g...
单细胞测序细胞类型鉴定
细胞类型鉴定细胞类型鉴定分两种思路一种是基于Marker gene，看某个亚群的差异基因（one to oth...
单细胞类型鉴定总结
细胞类型鉴定细胞类型鉴定分两种思路一种是基于Marker gene，看某个亚群的差异基因（one to oth...
04.寻找所有亚群的差异基因并输出
为方便注释时查看，及文章发表时上传补充材料。对所有亚群的marker基因进行文件输出参考来源：生信技能树单细胞公...
Celaref | 单细胞测序细胞类型注释工具
我导再也不用担心我不认识marker啦我们在进行单细胞测序的时候，通常情况下是通过高变genes来辨别细胞类型（...