美文网首页
plotly--16S注释桑基图--在线分析

plotly--16S注释桑基图--在线分析

作者: MR来了 | 来源:发表于2021-02-20 17:23 被阅读0次

1. 输入数据

  • 第一列为OTU id,最后一列为注释,其他的为样品
#OTU ID SN1     SN2     taxonomy
OTU0    13876   4102    k__Bacteria;p__Verrucomicrobia;c__Verrucomicrobiae;o__Verrucomicrobiales;f__Akkermansiaceae;g__Akkermansia;s__
OTU1    716     1855    k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Muribaculaceae;g__;s__
OTU2    1167    122     k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Erysipelotrichia;o__Erysipelotrichales;f__Erysipelotrichaceae;g__Dubosiella;s__
OTU3    1039    90      k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Erysipelotrichia;o__Erysipelotrichales;f__Erysipelotrichaceae;g__Dubosiella;s__
OTU5    2969    2535    k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Lactobacillales;f__Lactobacillaceae;g__Lactobacillus;s__

2. 互作图片

  • 可以选择最大注释级别和注释类别的比例cutoff值


    images.gif

3. APP说明

  • 主要分为背景介绍输入数据互作图片
    4.png

4. 在线分析

链接

相关文章

网友评论

      本文标题:plotly--16S注释桑基图--在线分析

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/shlxfltx.html