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在已安装了rstudio-server的docker容器中安装s

在已安装了rstudio-server的docker容器中安装s

作者: 马疾香幽_0702 | 来源:发表于2023-12-24 09:48 被阅读0次

0. 使用ssh作为中转站,在外网登录内网服务器:

例如:
外网穿透之后的服务器ip为:ip-外,port为:port-外;服务器登录名为:用户名。
需要转发的端口为shiny-server的端口3839。
登录时,我使用的是mobaxterm里面的wsl系统登录。输入如下代码:

ssh -p {port-外} -L 3839:localhost:3839 {用户名}@ip-外

之后根据提示键入密码。
之后,在浏览器内键入:http://127.0.0.1:3839/,即可成功登录。
或者直接使用mobaxterm的默认界面登录,ssh命令同上,浏览器里输入:localhost:3839即可。
这里注意,需要ssh的登录界面保持开启才可以保证浏览器内登录正常。ssh页面关闭后浏览器即无法登录。

1. docker内新端口的添加和暴露

最佳的方式还是在dockers容器运行的时候就添加好,不过也可以通过修改配置文件的方法来添加新端口。

  1. 首先运行docker ps命令,查找需要添加端口的容器id。
  2. 运行以下命令:cd /var/lib/docker/containers,之后找到对应的容器id目录,进入。
  3. 停止运行中的容器,并停止docker服务:
docker stop [容器id]
systemctl stop docker
  1. 进入2中的容器文件夹,编辑两个文件:hostconfig.json和config.v2.json
    以我现在添加的shiny端口为例,我需要暴露的容器内端口为3838,映射的主机端口为3839。
    首先编辑hostconfig.json文件,打开文件后,找到PortBindings项,以“,”分割,在{}内添加以下内容:
"3838/tcp":[{"HostIp":"","HostPort":"3839"}]

之后编辑config.v2.json文件,找到ExposedPorts项,同样以“,”分割,在{}内添加:

"3838/tcp":{}

保存退出。

  1. 重启docker服务和容器:
systemctl start docker
docker start [docker id]

2. shiny-server的下载和安装

这一步按照官网操作即可。我的docker容器是ubuntu系统,因此操作如下:

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download3.rstudio.org/ubuntu-18.04/x86_64/shiny-server-1.5.21.1012-amd64.deb
sudo gdebi shiny-server-1.5.21.1012-amd64.deb

这里需要注意,因为我是在已有的docker容器内安装的shiny-server,可能不存在一些直接pull下来的镜像的默认配置,shiny-server不是自动启动的,所以我写了一个启动的bash脚本:shiny_server_start.bash,只有一行命令:

shiny-server

然后执行:

nohup bash shiny_server_start.sh &

即可。可以使用服务器ip:3839的方式在网页中打开shiny-server。

3. shiny-server使用非默认位置的R

这个现在看起来应该是更改shiny这个用户里面的.bashrc,把现在的R位置添加进去即可。可能需要从sudo用户切换到shiny用户的操作:

sudo chsh -s /bin/bash shiny
sudo su - shiny

之后修改shiny中的bashrc文件,完成后用exit退出即可。

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