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生物笔记5-组蛋白修饰

生物笔记5-组蛋白修饰

作者: 江湾青年 | 来源:发表于2023-03-26 10:16 被阅读0次

    组蛋白结构

    在细胞核中,染色体是高度压缩的,而折叠时DNA缠绕的就是组蛋白。

    细胞和中的染色质和DNA

    将组蛋白区域放大,我们就会看到这样一串念珠,组蛋白被一根DNA序列串起来。

    多个核小体

    为了方便研究,我们将一个组蛋白和其附近 147bp DNA片段,叫一个核小体。也就是说,核小体 = 组蛋白 + DNA(147bp)

    单个核小体png

    把组蛋白拆开来,它其实有八个部分来构成:

    组蛋白八聚体 = 2个H2B + 2个H2A + 2个H3 + 2个H4

    单个核小体的组成

    下面是检测到的组蛋白三维结构示意图,可以看到,每种组蛋白结构都会伸出来一小段“线头”,这是蛋白质的N端,也叫尾巴(tail)。

    组蛋白三维结构

    事实上,每个组蛋白结构都会延伸出这个“尾巴”,组蛋白修饰就是在这个尾巴上进行的。

    组蛋白的N端修饰

    组蛋白修饰的描述规则

    这种修饰时一种以共价方式进行的蛋白质翻译后修饰(PTM),包括:甲基化(M),磷酸化(P),乙酰化(A)等等。

    由于组蛋白修饰的类型众多,所以我们需要在称呼组蛋白修饰时,有一个规则:

    组蛋白结构 + 氨基酸名称 + 氨基酸位置 + 修饰类型

    例如:

    H3K4me3:代表H3组蛋白的第4位赖氨酸的三甲基化
    H3K14ac:代表H3组蛋白的第14位赖氨酸的乙酰化

    组蛋白修饰的命名规则

    这些修饰都会影响基因的转录活性。而组蛋白H3是修饰最多的组蛋白。


    组蛋白修饰类型

    甲基化(me)、乙酰化(ac)

    不同组蛋白修饰的作用

    这些组蛋白修饰也可以共同作用来完成调控,比如,H3K9ac也与H3K14ac和H3K4me3高度共存共同作为活性基因启动子的标志。

    组蛋白修饰的检测

    一般我们使用 ChIPseq 来对样本测序,以此来拿到全基因组上的组蛋白修饰图谱。


    参考

    https://blog.csdn.net/u011262253/article/details/109957163

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