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pySCENIC运行报错：python3.9/site-pack

pySCENIC运行报错：python3.9/site-pack

作者: 嘿嘿嘿嘿哈 | 来源:发表于2024-08-03 00:11 被阅读0次

按照网上教程安装各种依赖包后，运行pyscenic仍然报错：

miniconda3/envs/pyscenic/lib/python3.9/site-packages/pyscenic/transform.py:42: FutureWarning: In the future `np.object` will be defined as the corresponding NumPy scalar.
  ("Enrichment", COLUMN_NAME_ANNOTATION): np.object,
Traceback (most recent call last):
  File "/home/lilab/miniconda3/envs/pyscenic/bin/pyscenic", line 5, in <module>
    from pyscenic.cli.pyscenic import main
...
image.png

经查阅是由以下原因导致的，[BUG] Installation error · Issue #518 · aertslab/pySCENIC · GitHub

重新安装numpy包，指定安装版本小于1.24就解决问题了

conda install -y numpy=1.23

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