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miRNA分析工具安装-randfold

miRNA分析工具安装-randfold

作者: MYS_bio_man | 来源:发表于2022-10-27 15:55 被阅读0次
    1. 首先,软件里面的说明(readme or install)通读一遍,安装不上,可能是(软件老)libs配置不齐、configure出错、跟系统的软件不配等等;
    1. 参考鲲鹏云服务器源码安装randfold,--help返回的信息告诉我安装没问题,可以用。开始跑流程进行分析,mirdeep2运行时出问题,还是配置不对。
    1. git-hub走一遭回来,【根据报错信息search “Can't locate PDF/API2.pm in @INC #87”】有了答案(如下命令),根源在于我要使用mirdeep2分析miRNA,其中涉及的一系列软件比较老,没怎么维护;好在git-hub上有人打包整理好了,git下来竟然也都是齐全的。”快乐的玩耍吧“~~~
    git clone https://github.com/rajewsky-lab/mirdeep2.git
    cd mirdeep2
    perl install.pl
    

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