前言 单细胞的拟时序分析是利用算法模拟不同细胞之间的分化趋势,目前已经是一种相对常规化的分析手段。通过拟时序分析,...
单细胞数据分析常用到建立trajectory和pseudoTime,拟时序分析可以用 Diffusion( Des...
单细胞拟时序分析,其实很简单,这里演示monocole2,因为我是tsne,想做热图看基因变化。 作图 热图
什么是拟时序分析?拟时序(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时...
说在前面 单细胞拟时序分析(Pseudotime)是揭示不同细胞之间分化轨迹的重要方式,在很多单细胞测序为主的研究...
拟时序分析是单细胞测序高级分析之一,其中引用量最多的一是Monocle,其次就是velocyto。velocyto...
Monocle包是一个强大的单细胞转录组数据分析工具,它引入了一个对单细胞进行排序的新方法(拟时序分析),通过利用...
最近在做单细胞的学习,跑拟时序分析代码(cds<- cluster_cells(cds))的时候,莫名奇妙的Rst...
Scanpy 是一个基于 Python 分析单细胞数据的软件包,内容包括预处理,可视化,聚类,拟时序分析和差异表达...
拟时间分析简介 拟时序(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分...
本文标题:单细胞拟时序分析5-monocle3-1简单介绍
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