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methylKit 统计方法

methylKit 统计方法

作者: horsefish | 来源:发表于2020-08-20 10:08 被阅读0次

    methylKit可以用来寻找DMR/DMC,其统计方法如下:

    1. logistic regression
    2. Fisher exact test

    有重复时methylKit调用 logistic regression,无重复时调用Fisher exact test

    methylKit也有自己独特的p-adjust方法SLIM
    用户也可以根据自己的需要选择传统的BH等p值校正方法。

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