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2020-06-18 aspera 下载 SRA数据,非常简单!

2020-06-18 aspera 下载 SRA数据,非常简单!

作者: 热爱大自然的小和尚 | 来源:发表于2020-06-18 16:51 被阅读0次

    Aspera 安装

    1. 安装aspera
      1. https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?list
    2. 选合适自己的操作系统的版本下载:
    3. 下面以Linux系统为例示范安装:
    tar zxvf ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar.gz
    bash ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.sh
    ###查看一下有没有安装上
    ls ~/.aspera  ###如果没有报错就安装好了
    

    安装 ena-fast-download.py

    1. 去github clone仓库git clone https://github.com/wwood/ena-fast-download
    2. 注意这个代码的依赖,确保你把下面三个软件都安装好!
      1. python3
      2. curl
      3. aspera

    使用:下载ERR1739691的正向和反向数据(这个是参考代码仓库里面的案例的)

    1. Linux: ./ena-fast-download.py ERR1739691
    2. OSX: ./ena-fast-download.py ERR1739691 --ssh_key osx

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