【数据库>>PROMO】寻找启动子的TF
作者:
高大石头 | 来源:发表于
2021-06-14 22:34 被阅读0次
1.启动子预测
1.1 UCSC Genome Browser
进入UCSC Genome Browser在里面输入目标基因,如ENST00000438158.1
。
出现这个界面后,选
LINC01705
接着选取
Genomic Sequence
最后设置前2000和后100为启动子区域
设置前2000和后100为启动子区域
输出启动子区域
2.TF预测
预测网站:PROMO
种属选择
输入启动子区域
注意:输入启动子序列时,不带">"部分内容。
产生的结果
3.真实案例
PMID: 33664479
参考资料:
- 启动子以及转录因子预测
- Long noncoding RNA ERLR mediates epithelial-mesenchymal transition of retinal pigment epithelial cells and promotes experimental proliferative vitreoretinopathy
本文标题:【数据库>>PROMO】寻找启动子的TF
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/tlzheltx.html
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