Required
- 注册github 账号：https://github.com/
- 安装windows git 软件：https://git-for-windows.github.io/
第一步：在线github网站创建GitHub 远程仓库：create a new repository
如图：
image.png
然后会出现以下页面, 此时显示该远程Github仓库建立完成
image
根据上图的页面提示，我们发现构建本地仓库和代码上传分为以下几个步骤：
echo "# README" >>README.md
git init
git add README.md
git commit -m "first commit"
git branch -M main
git remote add origin https://github.com/zzq/CCLE.git
git push -u origin main
此时我们需要在本地安装git软件，并运行以上这些命令进而实现代码上传。
第二步：本地傻瓜式安装windows git软件，
进入git bash 界面，输入git，若显示下图所示，则说明git软件安装成功
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第三步：创建本地git仓库，将数据上传至远程仓库中
$ mkdir github
$ cp code_files README.md .
$ git init ### 建立本地链接数据仓库
Reinitialized existing Git repository in C:/Users/ZZQ/Desktop/github/.git/
$ git add * ### 向本地仓库添加所有数据代码
# 初次使用git 上传代码时要设置config 文件
$ git config --global user.name " zzq"
$ git config --global user.email "zzq@sibcb.ac.cn"
$ git commit -m "first commit" ### 提交到本地缓冲，“ ”里说明提交了什么东西，说白了就是注释
[main 7fd0f11] CCLE_Code
3 files changed, 1262 insertions(+)
create mode 100644 CCLE_Expression_PDR.R
create mode 100644 CCLE_PDR.R
create mode 100644 CLL_Methylation_Level.tif
$ git branch -M main ##将文件上传到哪一个分支
### 以上步骤是将所以上传的文件打包到本地仓库中，然后通过git remote 上传到远程仓库
$ git remote add origin https://github.com/zzq/CCLE.git ### 将本地仓库的代码提交远程github的仓库，后面的地址就是之前创建github的远程仓库地址
## 若出现 error: remote origin already exists. 则先 git remote rm origin 然后再提交上一步命令
$ git push -u origin main ###将远程仓库的代码 push到main分支上
fatal: unable to access 'https://github.com/zzq/CCLE.git/': OpenSSL SSL_read: Connection was reset, errno 10054
# 解决的关键因素就是http.sslVerify 的配置需要设置为false，所以在git bash命令中执行：
$ git config --global http.sslVerify false # 然后再执行上一步命令
$ git push -u origin main
Enumerating objects: 8, done.
Counting objects: 100% (8/8), done.
Delta compression using up to 8 threads
Compressing objects: 100% (6/6), done.
Writing objects: 62% (5/8)
Writing objects: 100% (8/8), 1.44 MiB | 109.00 KiB/s, done.
Total 8 (delta 0), reused 0 (delta 0), pack-reused 0
To https://github.com/zhangzhiqiang2020/CCLE.git
* [new branch] main -> main
Branch 'main' set up to track remote branch 'main' from 'origin'.
此时显示代码上传成功，这时刷新远程的github页面，显示如下：
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Git的常用命令
# 查看、添加、提交、删除、找回，重置修改文件
git help <command> # 显示command的help
git show # 显示某次提交的内容 git show $id
git co -- <file> # 抛弃工作区修改
git co . # 抛弃工作区修改
git add <file> # 将工作文件修改提交到本地暂存区
git add . # 将所有修改过的工作文件提交暂存区
git rm <file> # 从版本库中删除文件
git rm <file> --cached # 从版本库中删除文件，但不删除文件
git reset <file> # 从暂存区恢复到工作文件
git reset -- . # 从暂存区恢复到工作文件
git reset --hard # 恢复最近一次提交过的状态，即放弃上次提交后的所有本次修改
git ci <file> git ci . git ci -a # 将git add, git rm和git ci等操作都合并在一起做 git ci -am "some comments"
git ci --amend # 修改最后一次提交记录
git revert <$id> # 恢复某次提交的状态，恢复动作本身也创建次提交对象
git revert HEAD # 恢复最后一次提交的状态
# 查看文件diff
git help <command> # 显示command的help
git show # 显示某次提交的内容 git show $id
git co -- <file> # 抛弃工作区修改
git co . # 抛弃工作区修改
git add <file> # 将工作文件修改提交到本地暂存区
git add . # 将所有修改过的工作文件提交暂存区
git rm <file> # 从版本库中删除文件
git rm <file> --cached # 从版本库中删除文件，但不删除文件
git reset <file> # 从暂存区恢复到工作文件
git reset -- . # 从暂存区恢复到工作文件
git reset --hard # 恢复最近一次提交过的状态，即放弃上次提交后的所有本次修改
git ci <file> git ci . git ci -a # 将git add, git rm和git ci等操作都合并在一起做 git ci -am "some comments"
git ci --amend # 修改最后一次提交记录
git revert <$id> # 恢复某次提交的状态，恢复动作本身也创建次提交对象
git revert HEAD # 恢复最后一次提交的状态
# 查看提交记录
git log git log <file> # 查看该文件每次提交记录
git log -p <file> # 查看每次详细修改内容的diff
git log -p -2 # 查看最近两次详细修改内容的diff
git log --stat #查看提交统计信息
# tig
# Mac上可以使用tig代替diff和log，brew install tig
# Git 本地分支管理
# 查看、切换、创建和删除分支
git br -r # 查看远程分支
git br <new_branch> # 创建新的分支
git br -v # 查看各个分支最后提交信息
git br --merged # 查看已经被合并到当前分支的分支
git br --no-merged # 查看尚未被合并到当前分支的分支
git co <branch> # 切换到某个分支
git co -b <new_branch> # 创建新的分支，并且切换过去
git co -b <new_branch> <branch> # 基于branch创建新的new_branch
git co $id # 把某次历史提交记录checkout出来，但无分支信息，切换到其他分支会自动删除
git co $id -b <new_branch> # 把某次历史提交记录checkout出来，创建成一个分支
git br -d <branch> # 删除某个分支
git br -D <branch> # 强制删除某个分支 (未被合并的分支被删除的时候需要强制)
# 分支合并和reba
git merge <branch> # 将branch分支合并到当前分支
git merge origin/master --no-ff # 不要Fast-Foward合并，这样可以生成merge提交
git rebase master <branch> # 将master rebase到branch，相当于： git co <branch> && git rebase master && git co master && git merge <branch>
# Git补丁管理(方便在多台机器上开发同步时用)
git merge <branch> # 将branch分支合并到当前分支
git merge origin/master --no-ff # 不要Fast-Foward合并，这样可以生成merge提交
git rebase master <branch> # 将master rebase到branch，相当于： git co <branch> && git rebase master && git co master && git merge <branch>
# Git暂存管
git stash # 暂存
git stash list # 列所有stash
git stash apply # 恢复暂存的内容
git stash drop # 删除暂存区
# Git远程分支管理
git pull # 抓取远程仓库所有分支更新并合并到本地
git pull --no-ff # 抓取远程仓库所有分支更新并合并到本地，不要快进合并
git fetch origin # 抓取远程仓库更新
git merge origin/master # 将远程主分支合并到本地当前分支
git co --track origin/branch # 跟踪某个远程分支创建相应的本地分支
git co -b <local_branch> origin/<remote_branch> # 基于远程分支创建本地分支，功能同上
# git push # push所有分支
git push origin master # 将本地主分支推到远程主分支
git push -u origin master # 将本地主分支推到远程(如无远程主分支则创建，用于初始化远程仓库)
git push origin <local_branch> # 创建远程分支， origin是远程仓库名
git push origin <local_branch>:<remote_branch> # 创建远程分支
git push origin :<remote_branch> #先删除本地分支(git br -d <branch>)，然后再push删除远程分支
# Git远程仓库管
git remote -v # 查看远程服务器地址和仓库名称
git remote show origin # 查看远程服务器仓库状态
git remote add origin git@ github:robbin/robbin_site.git # 添加远程仓库地址
git remote set-url origin git@ github.com:robbin/robbin_site.git # 设置远程仓库地址(用于修改远程仓库地址) git remote rm <repository> # 删除远程仓库
# 创建远程仓库
git clone --bare robbin_site robbin_site.git # 用带版本的项目创建纯版本仓库
scp -r my_project.git git@ git.csdn.net:~ # 将纯仓库上传到服务器上
mkdir robbin_site.git && cd robbin_site.git && git --bare init # 在服务器创建纯仓库
git remote add origin git@ github.com:robbin/robbin_site.git # 设置远程仓库地址
git push -u origin master # 客户端首次提交
git push -u origin develop # 首次将本地develop分支提交到远程develop分支，并且track
git remote set-head origin master # 设置远程仓库的HEAD指向master分支
# 也可以命令设置跟踪远程库和本地库
git branch --set-upstream master origin/master
git branch --set-upstream develop origin/develop
引用：
https://cloud.tencent.com/developer/article/1504684
https://www.jianshu.com/p/3ca2d0f049e7
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