终于配置、下载、编译、刷机各种环节均已打通，回归到自己的初始目标，去除每次重启插入usb后的权限弹窗提示。

环境

源码版本：5.1.1

修改

我们打开/frameworks/base/packages/SystemUI/src/com/android/systemui/usb/UsbPermissionActivity.java文件，伪代码如下：

public class UsbPermissionActivity extends AlertActivity
        implements DialogInterface.OnClickListener, CheckBox.OnCheckedChangeListener {
    ...
    private boolean mPermissionGranted;
   
    @Override
    public void onCreate(Bundle icicle) {
        super.onCreate(icicle);

        ...
        setupAlert();//弹窗
    }

    @Override
    public void onDestroy() {
       //onDestory相关操作，保存状态等
    }

    public void onClick(DialogInterface dialog, int which) {
        if (which == AlertDialog.BUTTON_POSITIVE) {//点击确定
            mPermissionGranted = true;
        }
        finish();
    }

    public void onCheckedChanged(CompoundButton buttonView, boolean isChecked) {
       //checkbox的处理
    }
}

源码很简单，确认授予权限的操作就是将mPermissionGranted改为true，然后将界面finish掉，出发onDestroy保存相关状态。
为了不显示该弹窗，我们直接在onCreate中去掉弹窗的操作，并添加点击确定按钮时的操作：

    @Override
    public void onCreate(Bundle icicle) {
        super.onCreate(icicle);

        ...
        //setupAlert();
        mPermissionGranted = true;
        finish();
    }

最后重新编译/frameworks/base/packages/SystemUI/模块，替换系统文件，重启开发板，验证成功。