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单细胞RNAseq - 踩坑 01 细胞类型鉴定边界不清,可能是

单细胞RNAseq - 踩坑 01 细胞类型鉴定边界不清,可能是

作者: QXPLUS | 来源:发表于2021-06-17 17:41 被阅读0次

    有时候我们在进行细胞类群鉴定的时候,有些边界很模糊,或者在进行亚群鉴定的时候,发现根本不能完全分开,这时候就要考虑一下是否有双细胞污染了。

    10X单细胞技术原理

    从10X单细胞技术原理上来看,如果配置的单细胞悬液浓度较大的话,就会出现一个GEM中带有2个或者2个以上的细胞,这就会给我们的数据分析造成干扰。

    先来看一下,双细胞鉴定结果吧(红色代表双细胞)


    双细胞

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