关键词: 微生物组,高通量基因测序,专家共识,国家标准,微生物组计划
摘要:在过去的十几年,微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时,全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划,进行多方面的布局,力争在这一具有广阔前景的领域获得战略地位。此外,无论是科研还是产业应用已经迎来了研究高潮和投融资热潮,微生物组相关产品和服务也不断出现。然而,行业在快速发展的同时,也存在一些不足。
由于微生物组测序和分析相关技术和方法发展迅速,各国研究和应用尚未在技术、方案和数据等标准上达成统一,国内行业参与者对微生物组也存在认识不足,对微生物组相关新方法、新技术、新理论等还未能充分掌握和使用。除此之外,已有的一些标准和指南,内容过于简单,实操性也不足,这不仅给科研数据的整合造成了困难和资源浪费,还给相关企业进行不良竞争、以次充好提供了机会。更重要的是,我国尚缺乏微生物组相关的国家标准,国家微生物组计划 仍处于筹备过程。在此背景下,中国生物工程学会、中国科学院微生物研究所于 2019 年 6 月至 2020 年 3 月,共 同设立了“微生物组测序与分析专家共识”专项研究课题。
中国生物工程学会组织了微生物组相关领域的 27 位专 家以及来自行业内的 30 多位专业人员,通过分成 4 个项目小组、召开 4 轮研讨会后,最终形成了涵盖从微生物采集与保存、DNA 提取与建库、高通量基因测序和数据分析以及质控标准品等全流程的“微生物组测序与分析专家共识”。本专家共识具有较强可参考性和可操作性,不仅能指导国内科研和产业机构规范进行微生物组相关产、学、研,还能为国家相关职能部门提供可参考的技术依据,保障规模型和规范化的企业利益,加强行业自律,避免不规范的企业扰乱市场,最终促进微生物组相关产业的良性发展。
《专家共识》详情
《微生物组测序与分析专家共识》
附录1《微生物组测序与分析专家共识的形成过程》
附录2《“微生物组测序与分析专家共识”细则》
附录3《扩增子测序数据分析流程和数据库补充列表》
附录4《元基因组测序数据分析流程和数据库补充列表》
附录5《单菌基因组测序数据分析流程和数据库补充列表》
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