ATAC-seq数据实战课程介绍

一直被模仿，从未被超越

这应该是你在市面上看到的第一个ATAC-seq数据分析流程，目前(截止到2018年8月)提供ATAC-seq测序及数据分析的公司不多，他们几乎不可能毫无保留的把吃饭的本领分享出来。

你很幸运，生信技能树非常愿意分享，所以你看到了这个视频教程，本来应该是承继我们的优良传统免费分享给大家学习，但是有几个非常大的压力阻止了我：

• 首先我们分享了生物信息学入门的系列教程，包括LINUX,R,GEO数据库挖掘，生信软件安装，还有WES,RNA-seq,ChIP-seq等ngs组学数据分析实战，约57小时的免费教学视频，得罪了不少靠此吃饭的同行。
• 其次，我们通过后台大数据分析发现超半数的学员并没有认真去学习我的视频，只是松鼠症的收集了，可能免费本身是对你的伤害。
• 最后，不是垃圾营销号把我的免费教学视频拿去卖钱，实在是可恶，让我心寒。

现在的情况是，已经免费的视频我是不会去收费，大家在B站或者YouTube自行学习，但是也不会更新，更没有售后。

而这个收费的视频我会组建团队提供比较好的服务，包括提供课程讲义，思维导图，测试数据，PPT，文献等等，尽可能的督促大家学会，而不是浪费时间和金钱。

所以请务必思考清楚再购买，成功购买的朋友们也请务必扫描小助手二维码，截图购买证据然后加入售后群。

优惠政策

我正在洽谈广告商赞助本视频课程，到时候至少会打7折，然后课程上新期间一个星期也是7折促销。

不过，如果你实在是手头拮据，也可以发邮件给我，完成两个作业：

• 生信人的linux习题 http://www.bio-info-trainee.com/2900.html ，
• 生信人的R语言习题 http://www.bio-info-trainee.com/3415.html

完成这两个作业，并且录制自己完成作业的解读视频发给我，我的邮箱是jmzeng1314@163.com 你可以拿到4折优惠券。

课程介绍

考虑到公司技术支持已经铺天盖地的宣传资料都已经给大家灌输了不少ATAC-seq实验细节，技术原理以及相关背景知识，所以我只是一笔带过。但是提供对应的资料希望大家可以自行阅读了解，你在这里听不到NGS测序原理，我推荐大家去看illumina官网宣传动画或者陈巍学基因的视频讲解，你也听不到表观的历史故事，技术发展史，这些我相信你完全可以自行搜索。

本次课程偏重于数据分析实战本身，需要一定的linux和R语言基础，如果不会，请先自行前往B站去学习我的免费视频教程。

本次实战演练的是The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos. Nature 2016文章里面的数据，这样的实战分析流程也可以很容易复现在其它文章，比如：Genome Res. 2018文章 An atlas of chromatin accessibility in the adult human brain ，又比如Cell 2018 July 18 文章：A Single-Cell Atlas of In Vivo Mammalian Chromatin Accessibility

我讲授的应该是一个通用技能，比如文章针对他们的双端数据使用的是 bowtie2 -t -q -N 1 -L 25 -X 2000 --no-mixed --no-discordant 参数 ，我视频里面给大家演示就不会那么复杂，而是鼓励大家去读原汁原味的说明书，或者调整参数进行比较学习。

新的工具层出不穷，我介绍了I-ATAC， esATAC，GUAVA，但也有一些工具，比如atacR，我实在是无法一一介绍，毕竟我想传授的是学习方法，而不是把所有旁枝末节一股脑的灌输给你。

目录如下：

而且还会根据学员反馈增添答疑视频

希望你能有所收获。