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如何解决caret包,naive bayes报错

如何解决caret包,naive bayes报错

作者: Jason数据分析生信教室 | 来源:发表于2021-02-09 10:38 被阅读0次

    昨天试了一下caret包的naive bayes分类模型的10-fold交叉验证。
    然后发现了如下的错误

    { でエラー: 
      task 1 failed - "Not all variable names used in object found in newdata"
     追加情報:  20 件の警告がありました (警告を見るには warnings() を使って下さい) 
    

    e1071的时候完全没问题可以建模,用caret就不行了。但是又想偷懒不想自己手写 k-fold的代码。还是自己写吧。

    • 首先要把数据打乱
    • 然后均等的把数据分成10份
    • 最后重复10次建模和验证。
      这样就不用受限于caret,用什么包什么机器学习方法都可以。
    #Randomly shuffle the data
    yourData<-yourData[sample(nrow(yourData)),]
    
    #Create 10 equally size folds
    folds <- cut(seq(1,nrow(yourData)),breaks=10,labels=FALSE)
    
    #Perform 10 fold cross validation
    for(i in 1:10){
        #Segement your data by fold using the which() function 
        testIndexes <- which(folds==i,arr.ind=TRUE)
        testData <- yourData[testIndexes, ]
        trainData <- yourData[-testIndexes, ]
        #Use the test and train data partitions however you desire...
    }
    

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