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真菌菌丝中总RNA的提取----TRNzol Universal

真菌菌丝中总RNA的提取----TRNzol Universal

作者: Han_zh | 来源:发表于2020-07-25 21:50 被阅读0次

    原理概述:
    RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的RNA必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。高浓度强变性剂异硫氰酸胍,可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,灭活RNA酶,所以RNA从细胞中释放出来时不被降解。细胞裂解后,除了RNA,还有DNA、蛋白质和细胞碎片,可通过酚、氯仿等有机溶剂处理得到纯化、完整的总RNA。
    真核细胞中含有多种RNA,如rRNA、mRNA、tRNA及一些小分子RNA。RNA以rRNA的数量最多,占80%-85%,tRNA及核内小分子 RNA10%-15%,而mRNA分子占1%-5%。


    核酸提取原则:
    ⑴ 保证核酸的完整性
    ⑵ 获得高纯度的核酸;
    ⑶ 操作简便,稳定性强。


    图片来自TIANGEN-mRNA.png
    一、利用TRNzol Universal总RNA提取试剂

    TRNzol Universal 是在TRNzol 基础上研发的含有指示剂的总RNA 提取试剂。该产品具有更强的裂解能力,更高的灵敏度,可从病毒、细菌、真菌、动物和植物细胞、组织、体液等样本中提取总RNA 的试剂。TRNzol Universal 能够充分裂解样本、溶解细胞内含物,并有效抑制RNase 活性,提取样本中的总RNA,同时保证了提取过程中RNA 的完整性。该试剂对样本起始量无限制,一个小时内即可完成反应。

    TRNzol Universal试剂.jpg
    1. 自备试剂
      氯仿、异丙醇、无菌水、75%乙醇(用无菌水配制)

    2. Prepare
      1.5ml离心管、计时器、液氮、研钵、镊子、涡旋振荡器、低温离心机、超微量分光光度计

    3. 注意事项:


      图片来自TIANGEN官网.png
    4. Steps


    ⑴ 取0.1g新鲜菌丝于液氮中快速研磨成粉末,转入1.5mL灭菌冷冻离心管中;
    ⑵ 涡旋混匀,室温静置5min;
    ⑶ 加入200μl氯仿,剧烈振荡15sec,室温放置3min;
    ⑷ 4℃ 12,000rpm离心15 min。样品会分成三层:粉色的有机相,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中,把水相约500 μl转移至新的1.5mL离心管中;


    离心后出现分层.jpg

    ⑸ 在得到的水相溶液中加入等体积异丙醇,混匀,室温放置10 min;
    ⑹ 4℃ 12,000 rpm离心10 min,去上清。离心前RNA沉淀经常是看不见的,离心后在管侧和管底形成胶状沉淀;
    ⑺ 加入1 ml 75%乙醇洗涤沉淀;
    ⑻ 4℃ 10,000 rpm 离心2min,倒出液体,剩余的少量液体短暂离心,然后用枪头吸出;
    ⑼ 室温放置3min晾干沉淀;
    ⑽ 加入30-50μl RNase-Free ddH2O,反复吹打、混匀,充分溶解RNA(冰上进行)。


    Min point :
    异硫氰酸胍裂解细胞,使得RNase失活;同时使得核酸蛋白复合物分离,将RNA释放到溶液中;
    酸性酚-氯仿抽提,低pH值的酚使RNA进入水相,蛋白和DNA留在有机相
    苯酚和脂类溶于有机溶剂氯仿中形成有机相;由于氯仿密度较大,使得有机相位于下层,而水相在上层
    异丙醇:沉淀RNA
    乙醇:沉淀RNA、除小分子、清除多余的有机溶剂
    测定OD260/280=1.9~2.1

    图片来自TIANGEN官网.png
    RNA溶于上层的水相.png
    Total RNA.png

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