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[软件]在anaconda的jupyte环境中配置R pytho

[软件]在anaconda的jupyte环境中配置R pytho

作者: 郑宝童 | 来源:发表于2018-11-15 15:10 被阅读88次

    1. 下载安装anaconda -官网 -清华的镜像:

    Anaconda 安装包可以到 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/ 下载。

    #下载安装conda
    wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh
    sh Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh
    

    环境变量配置
    打开家目录底下的.bash_profile
    vim ./.bash_profile

    #敲入
    export PATH=/home/zhengbt2017/anaconda3/bin:$PATH
    

    保存退出。然后在命令行界面敲下:

    source ./.bash_profile
    

    这样就把conda环境变量中。

    2. 添加清华的源(使得下载加速)

        conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
        conda config --set show_channel_urls yes
    

    添加第三方源

    当前tuna还维护了一些anaconda三方源。Conda Forge

       conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    

    msys2

       conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
    

    3conda update conda 升级版本conda
    4.添加库

    conda config --add channels conda-forge
    conda config --add channels defaults
    conda config --add channels r
    conda config --add channels bioconda
    

    5.安装python2.7

    conda create -n python2_env python=2

    activate python2_env

    conda install notebook ipykernel
    python -m ipykernel install --user

    6.安装R (建新环境)

    conda create -n R_env -c r-essentials (在当前环境下安装)

    conda install -c r r-essentials

    7.安装julia -下载安装julia

    -Pkg.update()

    -Pkg.add("IJulia")

    -notebook()

    启动jupyter只需要在cmd命令行界面敲入:
    jupyter notebook

    简书上还包含了许多关于conda的文章,这里也列出一些些,供学习参考:

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