Linux集群使用命令

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存储NAS 文件操作
df -h查看空间使用情况

警惕超大 nohup.out

任务提交
任务提交前

qhost--查看集群负载状态

qsub / qsub-sge.pl--提交任务

qstat--查看任务状态

qdel / qmod--任务控制

任务查看

qhost -j---列出所有用户在每个节点上的任务

qhost -q---列出每个节点上每个队列的任务数

qhost -u username---列出某个用户在每个节点上的任务

提交命令

qsub -cwd -q queue.q test.sh

qsub-sge.pl --maxproc 50 --resource vf=5G --queue queue.q test.sh

任务查看2

qstat -u username---查看某个用户的任务

qstat -u *,---查看所有用户的任务

qstat –j jobs_ID---查看某个任务的详细信息

查看.e和.o文件

.e：错误信息

.o：标准输出
任务控制

qdel jobID---删除某个任务

qdel -u username---删除某个用户的所有任务

qmod -s jobID--挂起某个任务

qmod -us jobID---继续运行某个挂起的任务

按任务占用内存大小选择相应的队列

查看队列 qstat -g c

QUEUE

PE.q--并行

cloud.q--云平台

general.q--96G节点

middle.q--96G节点

great.q--大内存节点

plus.q--大内存节点

single.q--Trinity组装

single._p.q---Trinity组装（占用内存较大）

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编辑于 2017-04-21