awk 引用外部变量，以及 END 的一个用法

指定窗口长度内变异位点的数目统计（带步长）

之前的介绍中提到 awk 可以通过 -v 选项引用外部变量，这里实践一下：

read sum3 sum4 < sum    # 读取文件名为 sum 的文件，并指定变量 sum3 和 sum4

cat count | while read num last    #   读取文件名为 count 的文件，并指定变量 num 和 last

do

    echo "Processing line: $num $last"       # 每一行处理完之前屏幕输出一句话，表明在正常运行

    awk -v t=$last -v sum3=$sum3 -v sum4=$sum4   -F ','    '$23==t {s3 += $3; s4 += $4} END {print s3/sum3 "\t" s4/sum4 "\t" t}'   test.csv >> result.txt 

done

脚本内容不多解释，比较简单，这里说一下这两句话的区别；

'$23==t {s3 += $3; s4 += $4} END {print s3/sum3 "\t" s4/sum4 "\t" t}' 

'$23==t {s3 += $3; s4 += $4; print s3/sum3 "\t" s4/sum4 "\t" t}' 

前者是对文件整体第三列和第四列求和，最后输出；

后者是每一行如此进行，随即输出，第一行就是第一行的第三列除以总和，第二行就是文件前两行求和然后除以总和，一行计算完随即输出一行，然后再计算第二行，输出第二行。