我们使用最多的Windows系统，它通常包括以下三种分区格式：FAT、Fat32、Ntfs三种分区格式，下面逐一说明：
什么是FAT分区？
FAT也就是FAT16分区，我们以前用的DOS、Windows95都使用FAT16文件系统，现在常用的Windows 98/2000/xp等系统均支持FAT16文件系统。它最大可以管理大到2GB的分区，但每个分区最多只能有65525个簇（簇是磁盘空间的配置单位）。随着硬盘或分区容量的增大，每个簇所占的空间将越来越大，从而导致硬盘空间的浪费。
什么是FAT32分区？
随着大容量硬盘的出现，从Windows 98开始，FAT32开始流行。它是FAT16的增强版本，可以支持大到2TB（2048GB)的分区。FAT32使用的簇比FAT16小，从而有效地节约了硬盘空间。
什么是NTFS分区？
它是微软Windows NT内核的系列操作系统支持的、一个特为网络和磁盘配额、文件加密等管理安全特性设计的磁盘格式。随着以NT为内核的Windows10/8/7/2000/XP的普及，很多个人用户开始用NTFS分区。NTFS也是以簇为单位来存储数据文件，但NTFS中簇的大小并不依赖于磁盘或分区的大小。簇尺寸的缩小不但降低了磁盘空间的浪费，还减少了产生磁盘碎片的可能。NTFS支持文件加密管理功能，可为用户提供更高层次的安全保证。
什么系统可以支持NTFS文件系统？
只有Windows NT/2000/XP/VISTA/7/10才能识别NTFS系统，Windows 9X/ME以及DOS等操作系统都不能支持、识别NTFS格式的磁盘。由于DOS系统不支持NTFS系统，所以最好不要将C:盘制作为NTFS系统，这样在系统崩溃后便于在DOS系统下修复。
在NTFS系统下，如何保护自己的文件、文件夹？
由于NTFS文件分区格式具有良好的安全性，如果你不希望自己硬盘中的文件被其他人调用或查看，使用权限控制方式加密是非常有效的方法。设置方法如下：以系统管理员身份登录，使用鼠标右键单击需要加密的文件夹，选择“Properties”，切换到“Security”选项卡。在“Group of user names”项中设置允许访问的用户只有Administrator和自己。删除其他的所有用户。保存设置退出即可。此后，其他用户将不能访问该文件夹。使用这项功能需要注意的是：一定要保证只有你一个人知道Administrator密码，并且设置其他用户不能属于Administrator。此外，你还可以详细的给每个用户设置权限，包括设置读取权限、写入权限、删除权限等，这样使用起来就更加灵活。你还可以设置权限，控制一个磁盘，或者磁盘分区只为自己使用，这样其他人就不能看到你的文件了。
FAT32和NTFS那种更好？
FAT32和NTFS是硬盘的两种分区格式，据权威机构测试的数据表明，FAT32会比NTFS快出5%，但是NTFS具有如下优点：1).能存取大于4GB的文件。2).能更好地诊断并修改硬盘错误。3).能管理大于40GB的单分区硬盘，另外，NTFS使用更小的簇大小，因此在一定程度上能节省硬盘空间。对于数据恢复来说，FAT32里面经常编辑修改的文件比如DOC、XLS、AI、CDR、PSD文件或者比较大的文件比如数据库等就很难恢复，而这些在NTFS分区里面恢复的效果很好。注：Windows98/ME默认情况下，不能存取NTFS分区格式，Linux可以读NTFS分区，但无法进行写操作。
Windows自带的分区管理工具
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