Nature：肿瘤内微生物群对肿瘤空间和细胞异质性的影响
Nature IF：69.504
本研究通过空间原位分析技术和单细胞RNA测序技术在口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中的应用，揭示了宿主-微生物在空间、细胞和分子上的相互作用。同时，开发了一种单细胞RNA测序方法，用于鉴定细胞相关细菌及其相互作用的宿主细胞。通过功能研究，发现被细菌感染的癌细胞作为单个细胞侵入其周围环境，并将骨髓细胞招募到细菌区域。总的来说，研究数据揭示了肿瘤内微生物群的分布不是随机的；相反，它在微细胞中高度组织，具有促进癌症进展的免疫和上皮细胞功能。
Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer
doi: 10.1038/s41586-022-05435-0
空间分辨多组学强调胃癌细胞特异性代谢重塑和相互作用
Nature Communications IF：16.6
该文章利用10x Visium空间转录组的多组学技术，对同一胃癌样本的内部代谢异质性和细胞代谢相互作用进行了层次化可视化。研究揭示了肿瘤相关的代谢重编程，并在代谢-转录水平上连接了标记的代谢物、基因和脂质。综合多组学数据，确定了复杂肿瘤微环境中的细胞类型和分布，并发现了一个以免疫细胞为主的“肿瘤-正常组织界面”区域，其中肿瘤细胞与邻近组织接触。这些发现有助于深入了解肿瘤生物学，为设计先进的治疗策略提供依据。
Spatially resolved multi-omics highlights cell-specific metabolic remodeling and interactions in gastric cancer
Doi：10.1038/s41467-023-38360-5
单细胞分析揭示了结肠直肠癌微环境中肥大细胞的激活（丛书）
《Cell & Bioscience》
本研究采用多组学方法，整合单细胞测序、空间转录组学和大量组织测序数据，研究肥大细胞（MCs）在结直肠癌（CRC）中的异质性和影响。研究揭示了肥大细胞在结直肠癌中的激活情况，并探讨了其潜在的机制和保护作用。研究还发现，激活的肥大细胞与其他细胞类型的相互作用更多，特别是与髓样细胞的相互作用。这些发现为理解癌症与免疫系统之间的复杂相互作用提供了新的视角。
Single-cell analysis unveils activation of mast cells in colorectal cancer microenvironment
doi：10.1186/s13578-023-01144-x
空间转录组学和免疫表型分析揭示结直肠癌肿瘤发生的分子和免疫学特征
Gut IF：17.943
本研究通过空间转录组学和免疫表型分析，揭示了结直肠癌肿瘤发生过程中的分子和免疫学特征。文章重点研究了肿瘤微环境中不同细胞在恶性转化过程中的作用，并采用DSP癌症转录组图谱归一化指南进行数据分析。此外，文章还发现了一些免疫调节基因在癌组织中的表达变化，这可能有助于晚期采用T细胞机制。最后，文章提出了一种识别结直肠癌肿瘤发生过程中持续改变的生物标志物的框架，这些见解有望改善早期结直肠癌患者的临床管理。
Transcriptomic and immunophenotypic proffling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis
doi: 10.1136/gutjnl-2022-327608
her2诱导的PD-L1破坏抑制患者源性胃癌类器官中肿瘤细胞免疫逃逸
Cancers IF：6.57
本文研究了Her2诱导的PD-L1在胃癌类器官样本中的免疫逃逸作用。利用DSP空间蛋白组、免疫组化等技术手段，探讨Her2-PD-L1相互作用在肿瘤中的免疫逃逸机制。研究发现研究发现，HER2和PD-L1的共同表达可能有助于肿瘤细胞免疫逃逸。此外，自体类器官/免疫细胞共培养可用于有效筛选对抗her2和免疫治疗组合的反应，从而为胃癌患者量身定制治疗方案。
Disruption of Her2-Induced PD-L1 Inhibits Tumor Cell Immune Evasion in Patient-Derived Gastric Cancer Organoids
doi：10.3390/cancers13246158
空间转录组助力早发性结直肠癌独特免疫特性的研究
ImmunoHorizons
本文利用DSP空间转录组技术，探讨了早期发病的结直肠癌的独特先天免疫特征。研究发现，与晚期发病的结直肠癌相比，免疫微环境在早发性结直肠癌中具有明显的先天免疫应答特征，而且这些免疫应答是独特的、位置依赖的。这些差异可能有助于解释为什么早期发病的结直肠癌更具侵袭性，并可能为开发新的治疗策略提供线索。
A Distinct Innate Immune Signature of Early Onset Colorectal Cancer
doi：10.4049/immunohorizons.2000092
Hedgehog转录效应物GLI介导mtor诱导的胃癌类器官PD-L1表达
Cancer Letters IF：9.7
本文利用DSP空间蛋白组、免疫组化、流式等技术，探讨了Hedgehog转录效应因子GLI在胃癌组织中通过mTOR诱导PD-L1表达的机制。研究表明，PDO/免疫细胞共培养可用于研究胃肿瘤微环境中MDSC的免疫抑制功能。mTOR信号通路介导GLI诱导的PD-L1在胃癌中的表达。该研究为胃癌免疫治疗提供了新的思路和潜在的治疗靶点。
Hedgehog transcriptional effector GLI mediates mTOR-Induced PD-L1 expression in gastric cancer organoids
doi：10.1016/j.canlet.2021.06.007
结直肠癌治疗相关肿瘤微环境空间蛋白组与空间转录组学特征分析
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology IF：5.89
文章介绍了利用DSP空间多组学技术，对接受新辅助化疗或联合免疫治疗（PD-1检查点抑制剂）的结直肠癌患者进行蛋白质和mRNA分析，揭示了与免疫治疗相关的肿瘤区域免疫浸润的显著特征。通过比较蛋白质和mRNA水平，发现蛋白质和mRNA水平之间存在高度一致性。这些发现为更精确的患者分层、治疗改进和免疫治疗疗效预测提供了重要信息。
Tumor Microenvironment Profiles Reveal Distinct Therapy-Oriented Proteogenomic Characteristics in Colorectal Cancer
doi：10.3389/fbioe.2021.757378
非因生物空间多组学技术优势
作为中国第一家引入DSP空间多组学技术平台的公司，非因生物目前拥有3台DSP仪器同时运行，也是全球最大的技术服务商。经过4年几百个项目实践经验的沉淀，无论是实验操作还是荧光标记抗体都积累了丰富的空间组学研究经验，处于领跑地位，为国内肿瘤生物学的研究做出了极大贡献。
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